RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477726.1

SIGMAR1-205, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-205ENST00000477726 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.87■■■■■ 8.14
SIGMAR1-205ENST00000477726 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.56■■■■■ 6.96
SIGMAR1-205ENST00000477726 ABCC9O60706 1549 aa57.14■■■■■ 6.74
SIGMAR1-205ENST00000477726 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.1■■■■■ 6.41
SIGMAR1-205ENST00000477726 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.08■■■■■ 6.41
SIGMAR1-205ENST00000477726 NACADO15069 1562 aa55.06■■■■■ 6.41
SIGMAR1-205ENST00000477726 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.88■■■■■ 6.38
SIGMAR1-205ENST00000477726 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.77■■■■■ 6.36
SIGMAR1-205ENST00000477726 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.56■■■■■ 6.32
SIGMAR1-205ENST00000477726 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.71■■■■■ 6.19
SIGMAR1-205ENST00000477726 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.4■■■■■ 6.147e-7■■■■□ 25.6
SIGMAR1-205ENST00000477726 SCRIBQ14160 1630 aa53.37■■■■■ 6.13
SIGMAR1-205ENST00000477726 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.27■■■■■ 6.12
SIGMAR1-205ENST00000477726 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.93■■■■■ 6.06
SIGMAR1-205ENST00000477726 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.24■■■■■ 5.95
SIGMAR1-205ENST00000477726 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.94■■■■■ 5.91
SIGMAR1-205ENST00000477726 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.69■■■■■ 5.87
SIGMAR1-205ENST00000477726 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.37■■■■■ 5.81
SIGMAR1-205ENST00000477726 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.11■■■■■ 5.77
SIGMAR1-205ENST00000477726 SMARCA4P51532 1647 aa51.09■■■■■ 5.77
SIGMAR1-205ENST00000477726 SMARCA2P51531 1590 aa50.81■■■■■ 5.72
SIGMAR1-205ENST00000477726 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.79■■■■■ 5.72
SIGMAR1-205ENST00000477726 NCAPD3P42695 1498 aa50.78■■■■■ 5.72
SIGMAR1-205ENST00000477726 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.71■■■■■ 5.71
SIGMAR1-205ENST00000477726 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.6■■■■■ 5.69
SIGMAR1-205ENST00000477726 HMGXB3Q12766 1538 aa50.54■■■■■ 5.68
SIGMAR1-205ENST00000477726 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.43■■■■■ 5.66
SIGMAR1-205ENST00000477726 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.2■■■■■ 5.63
SIGMAR1-205ENST00000477726 WIZO95785 1651 aa50.18■■■■■ 5.62
SIGMAR1-205ENST00000477726 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.71■■■■■ 5.55
SIGMAR1-205ENST00000477726 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.45■■■■■ 5.51
SIGMAR1-205ENST00000477726 NESP48681 1621 aa49.42■■■■■ 5.5
SIGMAR1-205ENST00000477726 ERCC6Q03468 1493 aa49.35■■■■■ 5.49
SIGMAR1-205ENST00000477726 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.32■■■■■ 5.49
SIGMAR1-205ENST00000477726 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.17■■■■■ 5.46
SIGMAR1-205ENST00000477726 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.11■■■■■ 5.45
SIGMAR1-205ENST00000477726 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.07■■■■■ 5.45
SIGMAR1-205ENST00000477726 CFTRP13569 1480 aa49.02■■■■■ 5.44
SIGMAR1-205ENST00000477726 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.87■■■■■ 5.41
SIGMAR1-205ENST00000477726 CUX2O14529 1486 aa48.78■■■■■ 5.4
SIGMAR1-205ENST00000477726 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.74■■■■■ 5.39
SIGMAR1-205ENST00000477726 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.69■■■■■ 5.39
SIGMAR1-205ENST00000477726 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
SIGMAR1-205ENST00000477726 PRDM2Q13029 1718 aa48.66■■■■■ 5.38
SIGMAR1-205ENST00000477726 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.58■■■■■ 5.37
SIGMAR1-205ENST00000477726 WDR62O43379 1518 aa48.39■■■■■ 5.34
SIGMAR1-205ENST00000477726 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
SIGMAR1-205ENST00000477726 ABCC8Q09428 1581 aa48.09■■■■■ 5.29
SIGMAR1-205ENST00000477726 TOPBP1Q92547 1522 aa47.95■■■■■ 5.27
SIGMAR1-205ENST00000477726 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.92■■■■■ 5.26
SIGMAR1-205ENST00000477726 IFT140Q96RY7 1462 aa47.68■■■■■ 5.22
SIGMAR1-205ENST00000477726 CUX1P39880 1505 aa47.58■■■■■ 5.21
SIGMAR1-205ENST00000477726 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
SIGMAR1-205ENST00000477726 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.44■■■■■ 5.18
SIGMAR1-205ENST00000477726 SOGA1O94964 1423 aa47.4■■■■■ 5.18
SIGMAR1-205ENST00000477726 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.4■■■■■ 5.18
SIGMAR1-205ENST00000477726 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.38■■■■■ 5.17
SIGMAR1-205ENST00000477726 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.33■■■■■ 5.17
SIGMAR1-205ENST00000477726 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.3■■■■■ 5.16
SIGMAR1-205ENST00000477726 TOP2BQ02880 1626 aa47.26■■■■■ 5.16
SIGMAR1-205ENST00000477726 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.23■■■■■ 5.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
SIGMAR1-205ENST00000477726 SYNJ1O43426 1573 aa47.18■■■■■ 5.14
SIGMAR1-205ENST00000477726 WDR97A6NE52 1622 aa47.15■■■■■ 5.14
SIGMAR1-205ENST00000477726 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.12■■■■■ 5.13
SIGMAR1-205ENST00000477726 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.12■■■■■ 5.132e-8■■■■■ 30.3
SIGMAR1-205ENST00000477726 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
SIGMAR1-205ENST00000477726 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.02■■■■■ 5.12
SIGMAR1-205ENST00000477726 GRIN2BQ13224 1484 aa46.85■■■■■ 5.09
SIGMAR1-205ENST00000477726 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.85■■■■■ 5.09
SIGMAR1-205ENST00000477726 OSCARQ8IYS5 282 aa46.81■■■■■ 5.08
SIGMAR1-205ENST00000477726 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.77■■■■■ 5.08
SIGMAR1-205ENST00000477726 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
SIGMAR1-205ENST00000477726 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.71■■■■■ 5.07
SIGMAR1-205ENST00000477726 PBRM1Q86U86 1689 aa46.7■■■■■ 5.07
SIGMAR1-205ENST00000477726 FBLN2P98095 1184 aa46.64■■■■■ 5.06
SIGMAR1-205ENST00000477726 CHD1O14646 1710 aa46.57■■■■■ 5.04
SIGMAR1-205ENST00000477726 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
SIGMAR1-205ENST00000477726 SYNJ2O15056 1496 aa46.52■■■■■ 5.04
SIGMAR1-205ENST00000477726 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.49■■■■■ 5.03
SIGMAR1-205ENST00000477726 KIF27Q86VH2 1401 aa46.45■■■■■ 5.03
SIGMAR1-205ENST00000477726 TRIM41Q8WV44 630 aa46.42■■■■■ 5.02
SIGMAR1-205ENST00000477726 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.34■■■■■ 5.01
SIGMAR1-205ENST00000477726 ADAMTS12P58397 1594 aa46.33■■■■■ 5.01
SIGMAR1-205ENST00000477726 GRIN2AQ12879 1464 aa46.2■■■■■ 4.99
SIGMAR1-205ENST00000477726 IGF1RP08069 1367 aa46.17■■■■■ 4.98
SIGMAR1-205ENST00000477726 CUL7Q14999 1698 aa46.1■■■■■ 4.97
SIGMAR1-205ENST00000477726 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.07■■■■■ 4.97
SIGMAR1-205ENST00000477726 NUP160Q12769 1436 aa45.99■■■■■ 4.95
SIGMAR1-205ENST00000477726 ARHGEF11O15085 1522 aa45.95■■■■■ 4.95
SIGMAR1-205ENST00000477726 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.95■■■■■ 4.95
SIGMAR1-205ENST00000477726 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.92■■■■■ 4.94
SIGMAR1-205ENST00000477726 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.92■■■■■ 4.94
SIGMAR1-205ENST00000477726 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.92■■■■■ 4.94
SIGMAR1-205ENST00000477726 CEP170Q5SW79 1584 aa45.91■■■■■ 4.94
SIGMAR1-205ENST00000477726 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.87■■■■■ 4.93
SIGMAR1-205ENST00000477726 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.83■■■■■ 4.93
SIGMAR1-205ENST00000477726 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.69■■■■■ 4.91
SIGMAR1-205ENST00000477726 EEA1Q15075 1411 aa45.68■■■■■ 4.9
SIGMAR1-205ENST00000477726 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.62■■■■■ 4.89
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