RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640136.1

NPTXR-202, Transcript of neuronal pentraxin receptor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPTXR, Length 1,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXR-202ENST00000640136 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.39■■■■■ 7.58
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NPTXR-202ENST00000640136 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.26■■■■■ 5.96
NPTXR-202ENST00000640136 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.73■■■■■ 5.87
NPTXR-202ENST00000640136 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.5■■■■■ 5.84
NPTXR-202ENST00000640136 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.5■■■■■ 5.84
NPTXR-202ENST00000640136 NACADO15069 1562 aa51.35■■■■■ 5.81
NPTXR-202ENST00000640136 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.08■■■■■ 5.77
NPTXR-202ENST00000640136 SCRIBQ14160 1630 aa50.16■■■■■ 5.62
NPTXR-202ENST00000640136 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.96■■■■■ 5.59
NPTXR-202ENST00000640136 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.93■■■■■ 5.58
NPTXR-202ENST00000640136 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.51■■■■■ 5.52
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NPTXR-202ENST00000640136 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.44■■■■■ 5.34
NPTXR-202ENST00000640136 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.28■■■■■ 5.32
NPTXR-202ENST00000640136 SMARCA4P51532 1647 aa48.14■■■■■ 5.3
NPTXR-202ENST00000640136 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.09■■■■■ 5.29
NPTXR-202ENST00000640136 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
NPTXR-202ENST00000640136 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.01■■■■■ 5.28
NPTXR-202ENST00000640136 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.7■■■■■ 5.23
NPTXR-202ENST00000640136 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.64■■■■■ 5.22
NPTXR-202ENST00000640136 WIZO95785 1651 aa47.62■■■■■ 5.21
NPTXR-202ENST00000640136 SMARCA2P51531 1590 aa47.58■■■■■ 5.21
NPTXR-202ENST00000640136 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.57■■■■■ 5.21
NPTXR-202ENST00000640136 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.56■■■■■ 5.2
NPTXR-202ENST00000640136 NCAPD3P42695 1498 aa47.37■■■■■ 5.17
NPTXR-202ENST00000640136 HMGXB3Q12766 1538 aa47.27■■■■■ 5.16
NPTXR-202ENST00000640136 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.23■■■■■ 5.15
NPTXR-202ENST00000640136 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
NPTXR-202ENST00000640136 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.04■■■■■ 5.12
NPTXR-202ENST00000640136 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.65■■■■■ 5.06
NPTXR-202ENST00000640136 CFTRP13569 1480 aa46.05■■■■■ 4.96
NPTXR-202ENST00000640136 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.04■■■■■ 4.96
NPTXR-202ENST00000640136 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.92■■■■■ 4.94
NPTXR-202ENST00000640136 NESP48681 1621 aa45.79■■■■■ 4.92
NPTXR-202ENST00000640136 PRDM2Q13029 1718 aa45.79■■■■■ 4.92
NPTXR-202ENST00000640136 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.54■■■■■ 4.88
NPTXR-202ENST00000640136 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.49■■■■■ 4.87
NPTXR-202ENST00000640136 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.32■■■■■ 4.85
NPTXR-202ENST00000640136 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.31■■■■■ 4.84
NPTXR-202ENST00000640136 ABCC8Q09428 1581 aa45.3■■■■■ 4.84
NPTXR-202ENST00000640136 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.26■■■■■ 4.84
NPTXR-202ENST00000640136 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.22■■■■■ 4.83
NPTXR-202ENST00000640136 ERCC6Q03468 1493 aa45.13■■■■■ 4.82
NPTXR-202ENST00000640136 CUX1P39880 1505 aa45.04■■■■■ 4.8
NPTXR-202ENST00000640136 SYNJ1O43426 1573 aa45.04■■■■■ 4.8
NPTXR-202ENST00000640136 TOP2BQ02880 1626 aa45.01■■■■■ 4.8
NPTXR-202ENST00000640136 MRC2Q9UBG0 1479 aa45■■■■■ 4.79
NPTXR-202ENST00000640136 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.99■■■■■ 4.79
NPTXR-202ENST00000640136 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.99■■■■■ 4.79
NPTXR-202ENST00000640136 TRIM41Q8WV44 630 aa44.98■■■■■ 4.79
NPTXR-202ENST00000640136 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
NPTXR-202ENST00000640136 TOPBP1Q92547 1522 aa44.92■■■■■ 4.78
NPTXR-202ENST00000640136 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
NPTXR-202ENST00000640136 WDR62O43379 1518 aa44.83■■■■■ 4.77
NPTXR-202ENST00000640136 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.68■■■■■ 4.74
NPTXR-202ENST00000640136 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.63■■■■■ 4.73
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NPTXR-202ENST00000640136 CUX2O14529 1486 aa44.43■■■■■ 4.7
NPTXR-202ENST00000640136 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.39■■■■■ 4.7
NPTXR-202ENST00000640136 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
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NPTXR-202ENST00000640136 IFT140Q96RY7 1462 aa44.33■■■■■ 4.69
NPTXR-202ENST00000640136 WDR97A6NE52 1622 aa44.29■■■■■ 4.68
NPTXR-202ENST00000640136 EEA1Q15075 1411 aa44.2■■■■■ 4.67
NPTXR-202ENST00000640136 KIF27Q86VH2 1401 aa44.18■■■■■ 4.66
NPTXR-202ENST00000640136 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.14■■■■■ 4.66
NPTXR-202ENST00000640136 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.06■■■■■ 4.64
NPTXR-202ENST00000640136 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
NPTXR-202ENST00000640136 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
NPTXR-202ENST00000640136 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.97■■■■■ 4.63
NPTXR-202ENST00000640136 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
NPTXR-202ENST00000640136 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.91■■■■■ 4.62
NPTXR-202ENST00000640136 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
NPTXR-202ENST00000640136 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.9■■■■■ 4.62
NPTXR-202ENST00000640136 IGF1RP08069 1367 aa43.85■■■■■ 4.61
NPTXR-202ENST00000640136 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.84■■■■■ 4.61
NPTXR-202ENST00000640136 GRIN2BQ13224 1484 aa43.79■■■■■ 4.6
NPTXR-202ENST00000640136 PBRM1Q86U86 1689 aa43.78■■■■■ 4.6
NPTXR-202ENST00000640136 PRXQ9BXM0 1461 aa43.68■■■■■ 4.58
NPTXR-202ENST00000640136 CUL7Q14999 1698 aa43.68■■■■■ 4.58
NPTXR-202ENST00000640136 KIF21BO75037 1637 aa43.64■■■■■ 4.58
NPTXR-202ENST00000640136 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.6■■■■■ 4.57
NPTXR-202ENST00000640136 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
NPTXR-202ENST00000640136 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.54■■■■■ 4.56
NPTXR-202ENST00000640136 ADAMTS12P58397 1594 aa43.53■■■■■ 4.56
NPTXR-202ENST00000640136 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.51■■■■■ 4.56
NPTXR-202ENST00000640136 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.49■■■■■ 4.55
NPTXR-202ENST00000640136 GOLGA3Q08378 1498 aa43.46■■■■■ 4.55
NPTXR-202ENST00000640136 SYNJ2O15056 1496 aa43.37■■■■■ 4.53
NPTXR-202ENST00000640136 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.36■■■■■ 4.53
NPTXR-202ENST00000640136 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.24■■■■■ 4.51
NPTXR-202ENST00000640136 GRIN2AQ12879 1464 aa43.24■■■■■ 4.51
NPTXR-202ENST00000640136 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
NPTXR-202ENST00000640136 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
NPTXR-202ENST00000640136 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.16■■■■■ 4.5
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NPTXR-202ENST00000640136 FBLN2P98095 1184 aa43.08■■■■■ 4.49
NPTXR-202ENST00000640136 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.01■■■■■ 4.48
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