RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316409.2

FAM89B-201, Transcript of family with sequence similarity 89 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM89B, Length 1,409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM89B-201ENST00000316409 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.23■■■■■ 8.19
FAM89B-201ENST00000316409 ABCC9O60706 1549 aa59.22■■■■■ 7.07
FAM89B-201ENST00000316409 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.18■■■■■ 7.06
FAM89B-201ENST00000316409 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.32■■■■■ 6.61
FAM89B-201ENST00000316409 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.03■■■■■ 6.56
FAM89B-201ENST00000316409 NACADO15069 1562 aa55.99■■■■■ 6.55
FAM89B-201ENST00000316409 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.48■■■■■ 6.47
FAM89B-201ENST00000316409 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.29■■■■■ 6.44
FAM89B-201ENST00000316409 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.24■■■■■ 6.43
FAM89B-201ENST00000316409 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.02■■■■■ 6.4
FAM89B-201ENST00000316409 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.91■■■■■ 6.38
FAM89B-201ENST00000316409 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.73■■■■■ 6.35
FAM89B-201ENST00000316409 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.63■■■■■ 6.34
FAM89B-201ENST00000316409 SCRIBQ14160 1630 aa54.11■■■■■ 6.25
FAM89B-201ENST00000316409 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.87■■■■■ 6.21
FAM89B-201ENST00000316409 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.42■■■■■ 6.14
FAM89B-201ENST00000316409 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.35■■■■■ 6.13
FAM89B-201ENST00000316409 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.29■■■■■ 6.12
FAM89B-201ENST00000316409 NCAPD3P42695 1498 aa51.75■■■■■ 5.87
FAM89B-201ENST00000316409 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.65■■■■■ 5.86
FAM89B-201ENST00000316409 SMARCA4P51532 1647 aa51.58■■■■■ 5.85
FAM89B-201ENST00000316409 SMARCA2P51531 1590 aa51.43■■■■■ 5.82
FAM89B-201ENST00000316409 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.35■■■■■ 5.81
FAM89B-201ENST00000316409 HMGXB3Q12766 1538 aa51.3■■■■■ 5.8
FAM89B-201ENST00000316409 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.13■■■■■ 5.78
FAM89B-201ENST00000316409 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.09■■■■■ 5.77
FAM89B-201ENST00000316409 ERCC6Q03468 1493 aa51.07■■■■■ 5.77
FAM89B-201ENST00000316409 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.03■■■■■ 5.76
FAM89B-201ENST00000316409 NESP48681 1621 aa50.95■■■■■ 5.75
FAM89B-201ENST00000316409 CUX2O14529 1486 aa50.84■■■■■ 5.73
FAM89B-201ENST00000316409 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.7■■■■■ 5.71
FAM89B-201ENST00000316409 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.47■■■■■ 5.67
FAM89B-201ENST00000316409 WIZO95785 1651 aa50.45■■■■■ 5.67
FAM89B-201ENST00000316409 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.25■■■■■ 5.64
FAM89B-201ENST00000316409 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.25■■■■■ 5.63
FAM89B-201ENST00000316409 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.23■■■■■ 5.63
FAM89B-201ENST00000316409 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.17■■■■■ 5.62
FAM89B-201ENST00000316409 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.12■■■■■ 5.61
FAM89B-201ENST00000316409 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.79■■■■■ 5.56
FAM89B-201ENST00000316409 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.78■■■■■ 5.56
FAM89B-201ENST00000316409 CFTRP13569 1480 aa49.66■■■■■ 5.54
FAM89B-201ENST00000316409 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.64■■■■■ 5.54
FAM89B-201ENST00000316409 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.64■■■■■ 5.54
FAM89B-201ENST00000316409 WDR62O43379 1518 aa49.63■■■■■ 5.54
FAM89B-201ENST00000316409 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.31■■■■■ 5.48
FAM89B-201ENST00000316409 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
FAM89B-201ENST00000316409 PRDM2Q13029 1718 aa49■■■■■ 5.43
FAM89B-201ENST00000316409 TOPBP1Q92547 1522 aa48.71■■■■■ 5.39
FAM89B-201ENST00000316409 OSCARQ8IYS5 282 aa48.68■■■■■ 5.38
FAM89B-201ENST00000316409 TRIM41Q8WV44 630 aa48.65■■■■■ 5.38
FAM89B-201ENST00000316409 IFT140Q96RY7 1462 aa48.64■■■■■ 5.38
FAM89B-201ENST00000316409 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.62■■■■■ 5.37
FAM89B-201ENST00000316409 ABCC8Q09428 1581 aa48.55■■■■■ 5.36
FAM89B-201ENST00000316409 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.5■■■■■ 5.35
FAM89B-201ENST00000316409 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.25■■■■■ 5.32
FAM89B-201ENST00000316409 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.24■■■■■ 5.31
FAM89B-201ENST00000316409 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.23■■■■■ 5.31
FAM89B-201ENST00000316409 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.22■■■■■ 5.31
FAM89B-201ENST00000316409 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
FAM89B-201ENST00000316409 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.13■■■■■ 5.3
FAM89B-201ENST00000316409 SOGA1O94964 1423 aa48.07■■■■■ 5.28
FAM89B-201ENST00000316409 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
FAM89B-201ENST00000316409 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.98■■■■■ 5.27
FAM89B-201ENST00000316409 CUX1P39880 1505 aa47.97■■■■■ 5.27
FAM89B-201ENST00000316409 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.93■■■■■ 5.26
FAM89B-201ENST00000316409 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.93■■■■■ 5.26
FAM89B-201ENST00000316409 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.93■■■■■ 5.26
FAM89B-201ENST00000316409 FBLN2P98095 1184 aa47.92■■■■■ 5.26
FAM89B-201ENST00000316409 CHD1O14646 1710 aa47.83■■■■■ 5.25
FAM89B-201ENST00000316409 ARHGEF11O15085 1522 aa47.82■■■■■ 5.25
FAM89B-201ENST00000316409 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.69■■■■■ 5.22
FAM89B-201ENST00000316409 WDR97A6NE52 1622 aa47.63■■■■■ 5.22
FAM89B-201ENST00000316409 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.59■■■■■ 5.21
FAM89B-201ENST00000316409 GRIN2BQ13224 1484 aa47.57■■■■■ 5.2
FAM89B-201ENST00000316409 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.56■■■■■ 5.2
FAM89B-201ENST00000316409 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.5■■■■■ 5.2
FAM89B-201ENST00000316409 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.45■■■■■ 5.19
FAM89B-201ENST00000316409 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.4■■■■■ 5.18
FAM89B-201ENST00000316409 ARAP1Q96P48 1450 aa47.4■■■■■ 5.18
FAM89B-201ENST00000316409 SYNJ2O15056 1496 aa47.37■■■■■ 5.17
FAM89B-201ENST00000316409 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.32■■■■■ 5.17
FAM89B-201ENST00000316409 PBRM1Q86U86 1689 aa47.3■■■■■ 5.16
FAM89B-201ENST00000316409 SYNJ1O43426 1573 aa47.3■■■■■ 5.16
FAM89B-201ENST00000316409 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.29■■■■■ 5.16
FAM89B-201ENST00000316409 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.27■■■■■ 5.16
FAM89B-201ENST00000316409 TOP2BQ02880 1626 aa47.19■■■■■ 5.14
FAM89B-201ENST00000316409 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.16■■■■■ 5.14
FAM89B-201ENST00000316409 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.98■■■■■ 5.11
FAM89B-201ENST00000316409 GRIN2AQ12879 1464 aa46.95■■■■■ 5.11
FAM89B-201ENST00000316409 ADAMTS12P58397 1594 aa46.91■■■■■ 5.1
FAM89B-201ENST00000316409 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.85■■■■■ 5.09
FAM89B-201ENST00000316409 NUP160Q12769 1436 aa46.79■■■■■ 5.08
FAM89B-201ENST00000316409 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.78■■■■■ 5.08
FAM89B-201ENST00000316409 CEP170Q5SW79 1584 aa46.78■■■■■ 5.08
FAM89B-201ENST00000316409 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.7■■■■■ 5.07
FAM89B-201ENST00000316409 SHROOM2Q13796 1616 aa46.49■■■■■ 5.03
FAM89B-201ENST00000316409 JPH4Q96JJ6 628 aa46.42■■■■■ 5.02
FAM89B-201ENST00000316409 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.38■■■■■ 5.01
FAM89B-201ENST00000316409 IGF1RP08069 1367 aa46.37■■■■■ 5.01
FAM89B-201ENST00000316409 KIF27Q86VH2 1401 aa46.34■■■■■ 5.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms