RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.62■■■■■ 8.25
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GNPTAB-202ENST00000392919 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.39■■■■■ 6.62
GNPTAB-202ENST00000392919 NACADO15069 1562 aa56.12■■■■■ 6.58
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.31■■■■■ 6.45
GNPTAB-202ENST00000392919 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.21■■■■■ 6.43
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GNPTAB-202ENST00000392919 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.05■■■■■ 6.4
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GNPTAB-202ENST00000392919 SCRIBQ14160 1630 aa54.33■■■■■ 6.29
GNPTAB-202ENST00000392919 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.96■■■■■ 6.23
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.39■■■■■ 6.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.39■■■■■ 6.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.14■■■■■ 6.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SMARCA4P51532 1647 aa51.86■■■■■ 5.89
GNPTAB-202ENST00000392919 NCAPD3P42695 1498 aa51.84■■■■■ 5.89
GNPTAB-202ENST00000392919 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.78■■■■■ 5.88
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GNPTAB-202ENST00000392919 SMARCA2P51531 1590 aa51.61■■■■■ 5.85
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GNPTAB-202ENST00000392919 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.39■■■■■ 5.82
GNPTAB-202ENST00000392919 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.32■■■■■ 5.81
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GNPTAB-202ENST00000392919 ERCC6Q03468 1493 aa50.92■■■■■ 5.74
GNPTAB-202ENST00000392919 WIZO95785 1651 aa50.8■■■■■ 5.72
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GNPTAB-202ENST00000392919 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.56■■■■■ 5.68
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GNPTAB-202ENST00000392919 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.29■■■■■ 5.64
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.28■■■■■ 5.64
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GNPTAB-202ENST00000392919 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.24■■■■■ 5.63
GNPTAB-202ENST00000392919 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.14■■■■■ 5.62
GNPTAB-202ENST00000392919 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.06■■■■■ 5.6
GNPTAB-202ENST00000392919 CFTRP13569 1480 aa49.83■■■■■ 5.57
GNPTAB-202ENST00000392919 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.82■■■■■ 5.57
GNPTAB-202ENST00000392919 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.73■■■■■ 5.55
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.71■■■■■ 5.55
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR62O43379 1518 aa49.68■■■■■ 5.54
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.61■■■■■ 5.53
GNPTAB-202ENST00000392919 PRDM2Q13029 1718 aa49.35■■■■■ 5.49
GNPTAB-202ENST00000392919 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.33■■■■■ 5.49
GNPTAB-202ENST00000392919 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.89■■■■■ 5.42
GNPTAB-202ENST00000392919 TOPBP1Q92547 1522 aa48.86■■■■■ 5.41
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCC8Q09428 1581 aa48.7■■■■■ 5.39
GNPTAB-202ENST00000392919 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.7■■■■■ 5.39
GNPTAB-202ENST00000392919 IFT140Q96RY7 1462 aa48.69■■■■■ 5.39
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.65■■■■■ 5.38
GNPTAB-202ENST00000392919 OSCARQ8IYS5 282 aa48.43■■■■■ 5.34
GNPTAB-202ENST00000392919 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.4■■■■■ 5.34
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GNPTAB-202ENST00000392919 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.37■■■■■ 5.33
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GNPTAB-202ENST00000392919 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.26■■■■■ 5.32
GNPTAB-202ENST00000392919 CUX1P39880 1505 aa48.23■■■■■ 5.31
GNPTAB-202ENST00000392919 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.18■■■■■ 5.3
GNPTAB-202ENST00000392919 SOGA1O94964 1423 aa48.18■■■■■ 5.3
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM41Q8WV44 630 aa48.13■■■■■ 5.3
GNPTAB-202ENST00000392919 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
GNPTAB-202ENST00000392919 CHD1O14646 1710 aa47.93■■■■■ 5.26
GNPTAB-202ENST00000392919 FBLN2P98095 1184 aa47.83■■■■■ 5.25
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR97A6NE52 1622 aa47.82■■■■■ 5.25
GNPTAB-202ENST00000392919 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.78■■■■■ 5.24
GNPTAB-202ENST00000392919 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.78■■■■■ 5.24
GNPTAB-202ENST00000392919 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.78■■■■■ 5.24
GNPTAB-202ENST00000392919 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.76■■■■■ 5.24
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF11O15085 1522 aa47.68■■■■■ 5.22
GNPTAB-202ENST00000392919 GRIN2BQ13224 1484 aa47.67■■■■■ 5.22
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.63■■■■■ 5.22
GNPTAB-202ENST00000392919 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.6■■■■■ 5.21
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GNPTAB-202ENST00000392919 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.59■■■■■ 5.21
GNPTAB-202ENST00000392919 SYNJ1O43426 1573 aa47.58■■■■■ 5.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TOP2BQ02880 1626 aa47.56■■■■■ 5.2
GNPTAB-202ENST00000392919 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.56■■■■■ 5.2
GNPTAB-202ENST00000392919 PBRM1Q86U86 1689 aa47.55■■■■■ 5.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.53■■■■■ 5.2
GNPTAB-202ENST00000392919 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SYNJ2O15056 1496 aa47.46■■■■■ 5.19
GNPTAB-202ENST00000392919 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.36■■■■■ 5.17
GNPTAB-202ENST00000392919 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.32■■■■■ 5.17
GNPTAB-202ENST00000392919 ARAP1Q96P48 1450 aa47.26■■■■■ 5.16
GNPTAB-202ENST00000392919 ADAMTS12P58397 1594 aa47.12■■■■■ 5.13
GNPTAB-202ENST00000392919 GRIN2AQ12879 1464 aa47.08■■■■■ 5.13
GNPTAB-202ENST00000392919 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.02■■■■■ 5.12
GNPTAB-202ENST00000392919 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.99■■■■■ 5.11
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP170Q5SW79 1584 aa46.93■■■■■ 5.1
GNPTAB-202ENST00000392919 NUP160Q12769 1436 aa46.9■■■■■ 5.1
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GNPTAB-202ENST00000392919 SHROOM2Q13796 1616 aa46.64■■■■■ 5.06
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF27Q86VH2 1401 aa46.62■■■■■ 5.05
GNPTAB-202ENST00000392919 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.61■■■■■ 5.05
GNPTAB-202ENST00000392919 IGF1RP08069 1367 aa46.6■■■■■ 5.05
GNPTAB-202ENST00000392919 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.46■■■■■ 5.03
GNPTAB-202ENST00000392919 CUL7Q14999 1698 aa46.43■■■■■ 5.02
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