RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.91■■■■■ 8.14
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.61■■■■■ 6.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABCC9O60706 1549 aa57.22■■■■■ 6.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.09■■■■■ 6.41
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NACADO15069 1562 aa55.03■■■■■ 6.4
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.97■■■■■ 6.39
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.92■■■■■ 6.38
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.71■■■■■ 6.35
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.53■■■■■ 6.32
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.95■■■■■ 6.23
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SCRIBQ14160 1630 aa53.47■■■■■ 6.15
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.45■■■■■ 6.15
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.45■■■■■ 6.15
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.84■■■■■ 6.05
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.42■■■■■ 5.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.01■■■■■ 5.92
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.79■■■■■ 5.88
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.39■■■■■ 5.82
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMARCA4P51532 1647 aa51.16■■■■■ 5.78
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.07■■■■■ 5.77
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.81■■■■■ 5.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.81■■■■■ 5.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMARCA2P51531 1590 aa50.77■■■■■ 5.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NCAPD3P42695 1498 aa50.76■■■■■ 5.72
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.64■■■■■ 5.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HMGXB3Q12766 1538 aa50.55■■■■■ 5.68
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.4■■■■■ 5.66
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WIZO95785 1651 aa50.31■■■■■ 5.64
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.22■■■■■ 5.63
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.74■■■■■ 5.55
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NESP48681 1621 aa49.56■■■■■ 5.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.45■■■■■ 5.51
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ERCC6Q03468 1493 aa49.29■■■■■ 5.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.28■■■■■ 5.48
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.13■■■■■ 5.46
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.06■■■■■ 5.44
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.04■■■■■ 5.44
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CFTRP13569 1480 aa49.02■■■■■ 5.44
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.99■■■■■ 5.43
HOXD-AS2-202ENST00000440016 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.82■■■■■ 5.41
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRDM2Q13029 1718 aa48.78■■■■■ 5.4
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CUX2O14529 1486 aa48.74■■■■■ 5.39
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.74■■■■■ 5.39
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.67■■■■■ 5.38
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.58■■■■■ 5.37
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WDR62O43379 1518 aa48.45■■■■■ 5.35
HOXD-AS2-202ENST00000440016 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.26■■■■■ 5.32
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TOPBP1Q92547 1522 aa47.98■■■■■ 5.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABCC8Q09428 1581 aa47.95■■■■■ 5.27
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.94■■■■■ 5.26
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CUX1P39880 1505 aa47.66■■■■■ 5.22
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IFT140Q96RY7 1462 aa47.64■■■■■ 5.22
HOXD-AS2-202ENST00000440016 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.58■■■■■ 5.21
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.52■■■■■ 5.2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.48■■■■■ 5.19
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.43■■■■■ 5.18
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.37■■■■■ 5.17
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SOGA1O94964 1423 aa47.36■■■■■ 5.17
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.35■■■■■ 5.17
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.3■■■■■ 5.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SYNJ1O43426 1573 aa47.28■■■■■ 5.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TOP2BQ02880 1626 aa47.28■■■■■ 5.16
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.16■■■■■ 5.14
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WDR97A6NE52 1622 aa47.15■■■■■ 5.14
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.01■■■■■ 5.12
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.87■■■■■ 5.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.82■■■■■ 5.09
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PBRM1Q86U86 1689 aa46.81■■■■■ 5.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GRIN2BQ13224 1484 aa46.8■■■■■ 5.08
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.75■■■■■ 5.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CHD1O14646 1710 aa46.71■■■■■ 5.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OSCARQ8IYS5 282 aa46.7■■■■■ 5.07
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.67■■■■■ 5.06
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FBLN2P98095 1184 aa46.55■■■■■ 5.04
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SYNJ2O15056 1496 aa46.5■■■■■ 5.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.45■■■■■ 5.03
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.43■■■■■ 5.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADAMTS12P58397 1594 aa46.4■■■■■ 5.02
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIF27Q86VH2 1401 aa46.35■■■■■ 5.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.28■■■■■ 5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM41Q8WV44 630 aa46.26■■■■■ 5
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GRIN2AQ12879 1464 aa46.21■■■■■ 4.99
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.16■■■■■ 4.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGF1RP08069 1367 aa46.14■■■■■ 4.98
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CUL7Q14999 1698 aa46.08■■■■■ 4.97
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.04■■■■■ 4.96
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.04■■■■■ 4.96
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.04■■■■■ 4.96
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CEP170Q5SW79 1584 aa46.01■■■■■ 4.96
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARHGEF11O15085 1522 aa46.01■■■■■ 4.96
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46■■■■■ 4.95
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUP160Q12769 1436 aa46■■■■■ 4.95
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.87■■■■■ 4.93
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.77■■■■■ 4.92
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SHROOM2Q13796 1616 aa45.7■■■■■ 4.91
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARAP1Q96P48 1450 aa45.64■■■■■ 4.9
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.62■■■■■ 4.89
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