RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403018.2

AUTS2-202, Transcript of AUTS2, activator of transcription and developmental regulator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AUTS2, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUTS2-202ENST00000403018 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.14■■■■■ 8.34
AUTS2-202ENST00000403018 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.83■■■■■ 7.17
AUTS2-202ENST00000403018 ABCC9O60706 1549 aa58.84■■■■■ 7.01
AUTS2-202ENST00000403018 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.5■■■■■ 6.63
AUTS2-202ENST00000403018 NACADO15069 1562 aa56.36■■■■■ 6.61
AUTS2-202ENST00000403018 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.28■■■■■ 6.6
AUTS2-202ENST00000403018 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.92■■■■■ 6.54
AUTS2-202ENST00000403018 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.82■■■■■ 6.53
AUTS2-202ENST00000403018 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.55■■■■■ 6.48
AUTS2-202ENST00000403018 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.17■■■■■ 6.42
AUTS2-202ENST00000403018 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.94■■■■■ 6.39
AUTS2-202ENST00000403018 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.74■■■■■ 6.35
AUTS2-202ENST00000403018 SCRIBQ14160 1630 aa54.54■■■■■ 6.32
AUTS2-202ENST00000403018 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.29■■■■■ 6.28
AUTS2-202ENST00000403018 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.2■■■■■ 6.27
AUTS2-202ENST00000403018 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.36■■■■■ 6.13
AUTS2-202ENST00000403018 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.22■■■■■ 6.11
AUTS2-202ENST00000403018 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.93■■■■■ 6.06
AUTS2-202ENST00000403018 SMARCA4P51532 1647 aa52.15■■■■■ 5.94
AUTS2-202ENST00000403018 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.07■■■■■ 5.93
AUTS2-202ENST00000403018 NCAPD3P42695 1498 aa52■■■■■ 5.92
AUTS2-202ENST00000403018 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.96■■■■■ 5.91
AUTS2-202ENST00000403018 SMARCA2P51531 1590 aa51.91■■■■■ 5.9
AUTS2-202ENST00000403018 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.7■■■■■ 5.87
AUTS2-202ENST00000403018 HMGXB3Q12766 1538 aa51.7■■■■■ 5.87
AUTS2-202ENST00000403018 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.66■■■■■ 5.86
AUTS2-202ENST00000403018 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.53■■■■■ 5.84
AUTS2-202ENST00000403018 WIZO95785 1651 aa51.14■■■■■ 5.78
AUTS2-202ENST00000403018 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.01■■■■■ 5.76
AUTS2-202ENST00000403018 NESP48681 1621 aa50.8■■■■■ 5.72
AUTS2-202ENST00000403018 ERCC6Q03468 1493 aa50.78■■■■■ 5.72
AUTS2-202ENST00000403018 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.69■■■■■ 5.71
AUTS2-202ENST00000403018 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.58■■■■■ 5.69
AUTS2-202ENST00000403018 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.47■■■■■ 5.67
AUTS2-202ENST00000403018 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.38■■■■■ 5.66
AUTS2-202ENST00000403018 CUX2O14529 1486 aa50.37■■■■■ 5.65
AUTS2-202ENST00000403018 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.21■■■■■ 5.63
AUTS2-202ENST00000403018 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.11■■■■■ 5.61
AUTS2-202ENST00000403018 CFTRP13569 1480 aa50.09■■■■■ 5.61
AUTS2-202ENST00000403018 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.01■■■■■ 5.6
AUTS2-202ENST00000403018 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.88■■■■■ 5.57
AUTS2-202ENST00000403018 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.86■■■■■ 5.57
AUTS2-202ENST00000403018 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.84■■■■■ 5.57
AUTS2-202ENST00000403018 PRDM2Q13029 1718 aa49.68■■■■■ 5.54
AUTS2-202ENST00000403018 WDR62O43379 1518 aa49.68■■■■■ 5.54
AUTS2-202ENST00000403018 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.51■■■■■ 5.52
AUTS2-202ENST00000403018 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.37■■■■■ 5.49
AUTS2-202ENST00000403018 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.21■■■■■ 5.47
AUTS2-202ENST00000403018 ABCC8Q09428 1581 aa49.08■■■■■ 5.45
AUTS2-202ENST00000403018 TOPBP1Q92547 1522 aa49.04■■■■■ 5.44
AUTS2-202ENST00000403018 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.96■■■■■ 5.43
AUTS2-202ENST00000403018 IFT140Q96RY7 1462 aa48.83■■■■■ 5.41
AUTS2-202ENST00000403018 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.59■■■■■ 5.37
AUTS2-202ENST00000403018 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.59■■■■■ 5.37
AUTS2-202ENST00000403018 CUX1P39880 1505 aa48.53■■■■■ 5.36
AUTS2-202ENST00000403018 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.52■■■■■ 5.36
AUTS2-202ENST00000403018 SOGA1O94964 1423 aa48.43■■■■■ 5.34
AUTS2-202ENST00000403018 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.42■■■■■ 5.34
AUTS2-202ENST00000403018 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.39■■■■■ 5.34
AUTS2-202ENST00000403018 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.38■■■■■ 5.34
AUTS2-202ENST00000403018 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.3■■■■■ 5.32
AUTS2-202ENST00000403018 OSCARQ8IYS5 282 aa48.26■■■■■ 5.32
AUTS2-202ENST00000403018 WDR97A6NE52 1622 aa48.17■■■■■ 5.3
AUTS2-202ENST00000403018 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.16■■■■■ 5.3
AUTS2-202ENST00000403018 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.13■■■■■ 5.3
AUTS2-202ENST00000403018 TOP2BQ02880 1626 aa48.05■■■■■ 5.28
AUTS2-202ENST00000403018 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.03■■■■■ 5.28
AUTS2-202ENST00000403018 SYNJ1O43426 1573 aa47.98■■■■■ 5.27
AUTS2-202ENST00000403018 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.97■■■■■ 5.27
AUTS2-202ENST00000403018 GRIN2BQ13224 1484 aa47.89■■■■■ 5.26
AUTS2-202ENST00000403018 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.85■■■■■ 5.25
AUTS2-202ENST00000403018 CHD1O14646 1710 aa47.85■■■■■ 5.25
AUTS2-202ENST00000403018 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.84■■■■■ 5.25
AUTS2-202ENST00000403018 FBLN2P98095 1184 aa47.84■■■■■ 5.25
AUTS2-202ENST00000403018 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.8■■■■■ 5.24
AUTS2-202ENST00000403018 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.78■■■■■ 5.24
AUTS2-202ENST00000403018 PBRM1Q86U86 1689 aa47.75■■■■■ 5.23
AUTS2-202ENST00000403018 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.67■■■■■ 5.22
AUTS2-202ENST00000403018 SYNJ2O15056 1496 aa47.61■■■■■ 5.21
AUTS2-202ENST00000403018 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.45■■■■■ 5.19
AUTS2-202ENST00000403018 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.45■■■■■ 5.19
AUTS2-202ENST00000403018 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.45■■■■■ 5.19
AUTS2-202ENST00000403018 TRIM41Q8WV44 630 aa47.45■■■■■ 5.19
AUTS2-202ENST00000403018 ARHGEF11O15085 1522 aa47.41■■■■■ 5.18
AUTS2-202ENST00000403018 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.39■■■■■ 5.18
AUTS2-202ENST00000403018 ADAMTS12P58397 1594 aa47.34■■■■■ 5.17
AUTS2-202ENST00000403018 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.33■■■■■ 5.17
AUTS2-202ENST00000403018 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.3■■■■■ 5.16
AUTS2-202ENST00000403018 GRIN2AQ12879 1464 aa47.26■■■■■ 5.16
AUTS2-202ENST00000403018 KIF27Q86VH2 1401 aa47.17■■■■■ 5.14
AUTS2-202ENST00000403018 NUP160Q12769 1436 aa47.05■■■■■ 5.12
AUTS2-202ENST00000403018 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.04■■■■■ 5.12
AUTS2-202ENST00000403018 CEP170Q5SW79 1584 aa47.02■■■■■ 5.12
AUTS2-202ENST00000403018 IGF1RP08069 1367 aa47■■■■■ 5.12
AUTS2-202ENST00000403018 ARAP1Q96P48 1450 aa46.99■■■■■ 5.11
AUTS2-202ENST00000403018 CUL7Q14999 1698 aa46.9■■■■■ 5.1
AUTS2-202ENST00000403018 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.73■■■■■ 5.07
AUTS2-202ENST00000403018 SHROOM2Q13796 1616 aa46.73■■■■■ 5.07
AUTS2-202ENST00000403018 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.64■■■■■ 5.06
AUTS2-202ENST00000403018 JPH4Q96JJ6 628 aa46.63■■■■■ 5.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.8 ms