Protein–RNA interactions for Protein: P51817

PRKX, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit PRKX, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKXP51817 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKXP51817 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKXP51817 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKXP51817 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKXP51817 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKXP51817 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKXP51817 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKXP51817 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKXP51817 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKXP51817 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKXP51817 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKXP51817 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKXP51817 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKXP51817 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKXP51817 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKXP51817 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKXP51817 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKXP51817 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKXP51817 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKXP51817 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKXP51817 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKXP51817 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKXP51817 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKXP51817 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKXP51817 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKXP51817 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKXP51817 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKXP51817 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKXP51817 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKXP51817 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKXP51817 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKXP51817 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKXP51817 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKXP51817 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKXP51817 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKXP51817 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKXP51817 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKXP51817 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKXP51817 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKXP51817 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKXP51817 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKXP51817 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKXP51817 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKXP51817 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKXP51817 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKXP51817 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKXP51817 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKXP51817 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKXP51817 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKXP51817 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKXP51817 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKXP51817 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKXP51817 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKXP51817 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKXP51817 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKXP51817 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKXP51817 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKXP51817 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKXP51817 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKXP51817 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKXP51817 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKXP51817 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKXP51817 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKXP51817 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKXP51817 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKXP51817 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKXP51817 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKXP51817 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKXP51817 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKXP51817 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKXP51817 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKXP51817 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKXP51817 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKXP51817 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKXP51817 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKXP51817 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKXP51817 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKXP51817 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKXP51817 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKXP51817 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKXP51817 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKXP51817 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKXP51817 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKXP51817 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKXP51817 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKXP51817 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKXP51817 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKXP51817 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKXP51817 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKXP51817 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKXP51817 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKXP51817 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKXP51817 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKXP51817 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKXP51817 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKXP51817 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKXP51817 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKXP51817 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKXP51817 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKXP51817 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms