RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246802.9

NOP53-201, Transcript of NOP53 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP53, Length 1,528 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53-201ENST00000246802 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.06■■■■■ 7.53
NOP53-201ENST00000246802 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.52■■■■■ 6.32
NOP53-201ENST00000246802 ABCC9O60706 1549 aa52.27■■■■■ 5.96
NOP53-201ENST00000246802 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.95■■■■■ 5.91
NOP53-201ENST00000246802 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.43■■■■■ 5.82
NOP53-201ENST00000246802 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.36■■■■■ 5.81
NOP53-201ENST00000246802 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.1■■■■■ 5.77
NOP53-201ENST00000246802 NACADO15069 1562 aa51■■■■■ 5.75
NOP53-201ENST00000246802 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.74■■■■■ 5.71
NOP53-201ENST00000246802 SCRIBQ14160 1630 aa49.93■■■■■ 5.58
NOP53-201ENST00000246802 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.88■■■■■ 5.58
NOP53-201ENST00000246802 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.64■■■■■ 5.54
NOP53-201ENST00000246802 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.25■■■■■ 5.47
NOP53-201ENST00000246802 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.13■■■■■ 5.455e-7■□□□□ 10.1
NOP53-201ENST00000246802 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.27■■■■■ 5.32
NOP53-201ENST00000246802 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
NOP53-201ENST00000246802 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.89■■■■■ 5.26
NOP53-201ENST00000246802 SMARCA4P51532 1647 aa47.87■■■■■ 5.25
NOP53-201ENST00000246802 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
NOP53-201ENST00000246802 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.81■■■■■ 5.24
NOP53-201ENST00000246802 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.58■■■■■ 5.21
NOP53-201ENST00000246802 WIZO95785 1651 aa47.42■■■■■ 5.18
NOP53-201ENST00000246802 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.37■■■■■ 5.17
NOP53-201ENST00000246802 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.32■■■■■ 5.17
NOP53-201ENST00000246802 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.31■■■■■ 5.16
NOP53-201ENST00000246802 SMARCA2P51531 1590 aa47.26■■■■■ 5.16
NOP53-201ENST00000246802 NCAPD3P42695 1498 aa47.1■■■■■ 5.13
NOP53-201ENST00000246802 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.97■■■■■ 5.11
NOP53-201ENST00000246802 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.95■■■■■ 5.11
NOP53-201ENST00000246802 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.1
NOP53-201ENST00000246802 HMGXB3Q12766 1538 aa46.92■■■■■ 5.1
NOP53-201ENST00000246802 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.46■■■■■ 5.03
NOP53-201ENST00000246802 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.81■■■■■ 4.92
NOP53-201ENST00000246802 CFTRP13569 1480 aa45.79■■■■■ 4.92
NOP53-201ENST00000246802 NESP48681 1621 aa45.63■■■■■ 4.9
NOP53-201ENST00000246802 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.6■■■■■ 4.89
NOP53-201ENST00000246802 PRDM2Q13029 1718 aa45.44■■■■■ 4.86
NOP53-201ENST00000246802 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.27■■■■■ 4.84
NOP53-201ENST00000246802 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.26■■■■■ 4.84
NOP53-201ENST00000246802 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.16■■■■■ 4.82
NOP53-201ENST00000246802 ABCC8Q09428 1581 aa45.14■■■■■ 4.82
NOP53-201ENST00000246802 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.06■■■■■ 4.8
NOP53-201ENST00000246802 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.05■■■■■ 4.8
NOP53-201ENST00000246802 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45■■■■■ 4.79
NOP53-201ENST00000246802 ERCC6Q03468 1493 aa44.89■■■■■ 4.78
NOP53-201ENST00000246802 TRIM41Q8WV44 630 aa44.85■■■■■ 4.77
NOP53-201ENST00000246802 CUX1P39880 1505 aa44.83■■■■■ 4.77
NOP53-201ENST00000246802 SYNJ1O43426 1573 aa44.83■■■■■ 4.77
NOP53-201ENST00000246802 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
NOP53-201ENST00000246802 TOP2BQ02880 1626 aa44.75■■■■■ 4.75
NOP53-201ENST00000246802 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.74■■■■■ 4.75
NOP53-201ENST00000246802 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.71■■■■■ 4.75
NOP53-201ENST00000246802 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.7■■■■■ 4.75
NOP53-201ENST00000246802 TOPBP1Q92547 1522 aa44.68■■■■■ 4.74
NOP53-201ENST00000246802 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
NOP53-201ENST00000246802 WDR62O43379 1518 aa44.55■■■■■ 4.72
NOP53-201ENST00000246802 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.47■■■■■ 4.71
NOP53-201ENST00000246802 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
NOP53-201ENST00000246802 SOGA1O94964 1423 aa44.25■■■■■ 4.67
NOP53-201ENST00000246802 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.23■■■■■ 4.67
NOP53-201ENST00000246802 CUX2O14529 1486 aa44.22■■■■■ 4.67
NOP53-201ENST00000246802 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
NOP53-201ENST00000246802 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.09■■■■■ 4.65
NOP53-201ENST00000246802 IFT140Q96RY7 1462 aa44.06■■■■■ 4.64
NOP53-201ENST00000246802 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.04■■■■■ 4.64
NOP53-201ENST00000246802 WDR97A6NE52 1622 aa44■■■■■ 4.63
NOP53-201ENST00000246802 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.63
NOP53-201ENST00000246802 KIF27Q86VH2 1401 aa43.94■■■■■ 4.62
NOP53-201ENST00000246802 EEA1Q15075 1411 aa43.91■■■■■ 4.62
NOP53-201ENST00000246802 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
NOP53-201ENST00000246802 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
NOP53-201ENST00000246802 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.78■■■■■ 4.6
NOP53-201ENST00000246802 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.76■■■■■ 4.6
NOP53-201ENST00000246802 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.75■■■■■ 4.598e-7■■■■□ 22
NOP53-201ENST00000246802 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.74■■■■■ 4.59
NOP53-201ENST00000246802 IGF1RP08069 1367 aa43.68■■■■■ 4.58
NOP53-201ENST00000246802 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
NOP53-201ENST00000246802 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.56■■■■■ 4.56
NOP53-201ENST00000246802 GRIN2BQ13224 1484 aa43.54■■■■■ 4.56
NOP53-201ENST00000246802 PBRM1Q86U86 1689 aa43.51■■■■■ 4.56
NOP53-201ENST00000246802 PRXQ9BXM0 1461 aa43.46■■■■■ 4.55
NOP53-201ENST00000246802 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.41■■■■■ 4.54
NOP53-201ENST00000246802 CUL7Q14999 1698 aa43.37■■■■■ 4.53
NOP53-201ENST00000246802 KIF21BO75037 1637 aa43.37■■■■■ 4.53
NOP53-201ENST00000246802 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.36■■■■■ 4.53
NOP53-201ENST00000246802 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.33■■■■■ 4.53
NOP53-201ENST00000246802 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.29■■■■■ 4.52
NOP53-201ENST00000246802 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.28■■■■■ 4.52
NOP53-201ENST00000246802 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
NOP53-201ENST00000246802 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.27■■■■■ 4.52
NOP53-201ENST00000246802 ADAMTS12P58397 1594 aa43.26■■■■■ 4.52
NOP53-201ENST00000246802 GOLGA3Q08378 1498 aa43.23■■■■■ 4.51
NOP53-201ENST00000246802 SYNJ2O15056 1496 aa43.11■■■■■ 4.49
NOP53-201ENST00000246802 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
NOP53-201ENST00000246802 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
NOP53-201ENST00000246802 GRIN2AQ12879 1464 aa43■■■■■ 4.47
NOP53-201ENST00000246802 FBLN2P98095 1184 aa42.97■■■■■ 4.47
NOP53-201ENST00000246802 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.96■■■■■ 4.47
NOP53-201ENST00000246802 CHD1O14646 1710 aa42.84■■■■■ 4.45
NOP53-201ENST00000246802 NUP160Q12769 1436 aa42.77■■■■■ 4.44
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