Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC24A2Q9UI40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC24A2Q9UI40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC24A2Q9UI40 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC24A2Q9UI40 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC24A2Q9UI40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC24A2Q9UI40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC24A2Q9UI40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC24A2Q9UI40 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC24A2Q9UI40 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC24A2Q9UI40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC24A2Q9UI40 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC24A2Q9UI40 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC24A2Q9UI40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC24A2Q9UI40 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC24A2Q9UI40 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC24A2Q9UI40 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC24A2Q9UI40 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC24A2Q9UI40 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC24A2Q9UI40 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC24A2Q9UI40 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC24A2Q9UI40 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC24A2Q9UI40 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC24A2Q9UI40 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC24A2Q9UI40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC24A2Q9UI40 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC24A2Q9UI40 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC24A2Q9UI40 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC24A2Q9UI40 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC24A2Q9UI40 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC24A2Q9UI40 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC24A2Q9UI40 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC24A2Q9UI40 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC24A2Q9UI40 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC24A2Q9UI40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC24A2Q9UI40 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC24A2Q9UI40 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC24A2Q9UI40 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC24A2Q9UI40 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC24A2Q9UI40 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC24A2Q9UI40 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC24A2Q9UI40 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC24A2Q9UI40 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms