Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR1Q9C0D0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR1Q9C0D0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHACTR1Q9C0D0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHACTR1Q9C0D0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHACTR1Q9C0D0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PHACTR1Q9C0D0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR1Q9C0D0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR1Q9C0D0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHACTR1Q9C0D0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHACTR1Q9C0D0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR1Q9C0D0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHACTR1Q9C0D0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHACTR1Q9C0D0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHACTR1Q9C0D0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHACTR1Q9C0D0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHACTR1Q9C0D0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR1Q9C0D0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms