Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF1BP20333 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF1BP20333 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF1BP20333 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF1BP20333 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF1BP20333 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF1BP20333 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF1BP20333 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF1BP20333 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF1BP20333 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF1BP20333 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF1BP20333 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF1BP20333 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF1BP20333 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF1BP20333 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF1BP20333 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF1BP20333 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF1BP20333 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF1BP20333 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFRSF1BP20333 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFRSF1BP20333 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF1BP20333 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF1BP20333 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms