Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
J3KTA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
J3KTA2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
J3KTA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
J3KTA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
J3KTA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
J3KTA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
J3KTA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
J3KTA2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
J3KTA2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
J3KTA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
J3KTA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
J3KTA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KTA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KTA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KTA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KTA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KTA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
J3KTA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
J3KTA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
J3KTA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
J3KTA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
J3KTA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
J3KTA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
J3KTA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
J3KTA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
J3KTA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
J3KTA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3KTA2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
J3KTA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
J3KTA2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
J3KTA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
J3KTA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
J3KTA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
J3KTA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
J3KTA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
J3KTA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
J3KTA2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
J3KTA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
J3KTA2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
J3KTA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
J3KTA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
J3KTA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
J3KTA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
J3KTA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
J3KTA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
J3KTA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
J3KTA2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
J3KTA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
J3KTA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
J3KTA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
J3KTA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
J3KTA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
J3KTA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
J3KTA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
J3KTA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
J3KTA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
J3KTA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
J3KTA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
J3KTA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
J3KTA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
J3KTA2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
J3KTA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
J3KTA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
J3KTA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
J3KTA2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
J3KTA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
J3KTA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
J3KTA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
J3KTA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
J3KTA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
J3KTA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
J3KTA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
J3KTA2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
J3KTA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
J3KTA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
J3KTA2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
J3KTA2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
J3KTA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
J3KTA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3KTA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3KTA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3KTA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3KTA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3KTA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
J3KTA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
J3KTA2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
J3KTA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
J3KTA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KTA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KTA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
J3KTA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
J3KTA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
J3KTA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
J3KTA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
J3KTA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
J3KTA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KTA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KTA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KTA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms