Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCCD1A6NED2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCCD1A6NED2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RCCD1A6NED2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCCD1A6NED2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCCD1A6NED2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCCD1A6NED2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCCD1A6NED2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCCD1A6NED2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCCD1A6NED2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RCCD1A6NED2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RCCD1A6NED2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCCD1A6NED2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCCD1A6NED2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCCD1A6NED2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCCD1A6NED2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCCD1A6NED2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCCD1A6NED2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RCCD1A6NED2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCCD1A6NED2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
RCCD1A6NED2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCCD1A6NED2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCCD1A6NED2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCCD1A6NED2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCCD1A6NED2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCCD1A6NED2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCCD1A6NED2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCCD1A6NED2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCCD1A6NED2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCCD1A6NED2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCCD1A6NED2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCCD1A6NED2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCCD1A6NED2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCCD1A6NED2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RCCD1A6NED2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RCCD1A6NED2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RCCD1A6NED2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RCCD1A6NED2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RCCD1A6NED2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCCD1A6NED2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RCCD1A6NED2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RCCD1A6NED2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms