Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RCCD1A6NED2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RCCD1A6NED2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RCCD1A6NED2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RCCD1A6NED2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RCCD1A6NED2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
RCCD1A6NED2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RCCD1A6NED2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RCCD1A6NED2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RCCD1A6NED2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RCCD1A6NED2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RCCD1A6NED2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RCCD1A6NED2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RCCD1A6NED2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RCCD1A6NED2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RCCD1A6NED2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RCCD1A6NED2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RCCD1A6NED2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RCCD1A6NED2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RCCD1A6NED2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RCCD1A6NED2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RCCD1A6NED2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RCCD1A6NED2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RCCD1A6NED2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RCCD1A6NED2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RCCD1A6NED2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RCCD1A6NED2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RCCD1A6NED2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RCCD1A6NED2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RCCD1A6NED2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RCCD1A6NED2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RCCD1A6NED2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RCCD1A6NED2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RCCD1A6NED2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RCCD1A6NED2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RCCD1A6NED2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RCCD1A6NED2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RCCD1A6NED2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RCCD1A6NED2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RCCD1A6NED2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RCCD1A6NED2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RCCD1A6NED2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RCCD1A6NED2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RCCD1A6NED2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RCCD1A6NED2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RCCD1A6NED2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RCCD1A6NED2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RCCD1A6NED2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RCCD1A6NED2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RCCD1A6NED2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RCCD1A6NED2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RCCD1A6NED2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RCCD1A6NED2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RCCD1A6NED2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RCCD1A6NED2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RCCD1A6NED2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RCCD1A6NED2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RCCD1A6NED2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RCCD1A6NED2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RCCD1A6NED2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RCCD1A6NED2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RCCD1A6NED2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RCCD1A6NED2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RCCD1A6NED2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RCCD1A6NED2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RCCD1A6NED2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RCCD1A6NED2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RCCD1A6NED2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RCCD1A6NED2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RCCD1A6NED2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RCCD1A6NED2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RCCD1A6NED2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RCCD1A6NED2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RCCD1A6NED2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RCCD1A6NED2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RCCD1A6NED2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RCCD1A6NED2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RCCD1A6NED2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RCCD1A6NED2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RCCD1A6NED2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RCCD1A6NED2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RCCD1A6NED2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RCCD1A6NED2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RCCD1A6NED2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RCCD1A6NED2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RCCD1A6NED2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RCCD1A6NED2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RCCD1A6NED2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RCCD1A6NED2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RCCD1A6NED2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RCCD1A6NED2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RCCD1A6NED2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RCCD1A6NED2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RCCD1A6NED2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
RCCD1A6NED2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RCCD1A6NED2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RCCD1A6NED2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RCCD1A6NED2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RCCD1A6NED2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RCCD1A6NED2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms