Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 NUMB-224ENST00000556989 1897 ntTSL 25.36□□□□□ -1.551e-10■■■■■ 47.3
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SF3B4Q15427 NUMB-220ENST00000556112 568 ntTSL 43.89□□□□□ -1.791e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 TOP2A-203ENST00000577706 554 ntTSL 23.69□□□□□ -1.821e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 LEMD3-204ENST00000542032 645 ntTSL 33.64□□□□□ -1.831e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-15■■■■■ 47.3
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SF3B4Q15427 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.472e-15■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 SUSD1-206ENST00000475283 743 ntTSL 312.85□□□□□ -0.352e-15■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 SUSD1-201ENST00000355396 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.38□□□□□ -0.752e-15■■■■■ 47.3
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SF3B4Q15427 PPIL2-208ENST00000484439 863 ntTSL 56.82□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 47.2
SF3B4Q15427 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.934e-47■■■■■ 47.2
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SF3B4Q15427 INTS8-202ENST00000517918 394 ntTSL 52.68□□□□□ -1.984e-7■■■■■ 47.2
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SF3B4Q15427 STIM1-207ENST00000526771 457 ntTSL 47.88□□□□□ -1.153e-9■■■■■ 47.1
SF3B4Q15427 STIM1-210ENST00000528656 581 ntTSL 47.3□□□□□ -1.243e-9■■■■■ 47.1
SF3B4Q15427 STIM1-208ENST00000527484 568 ntTSL 46.84□□□□□ -1.313e-9■■■■■ 47.1
SF3B4Q15427 STIM1-204ENST00000525403 625 ntTSL 46.57□□□□□ -1.363e-9■■■■■ 47.1
SF3B4Q15427 STIM1-214ENST00000532919 580 ntTSL 45.44□□□□□ -1.543e-9■■■■■ 47.1
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SF3B4Q15427 PPP2R3B-206ENST00000477110 5802 ntTSL 1 (best)17.7■□□□□ 0.427e-10■■■■■ 47.1
SF3B4Q15427 PPP2R3B-209ENST00000484364 732 ntTSL 216.51■□□□□ 0.237e-10■■■■■ 47.1
SF3B4Q15427 PPP2R3B-204ENST00000468169 713 ntTSL 312.81□□□□□ -0.367e-10■■■■■ 47.1
SF3B4Q15427 ATG4B-219ENST00000479941 374 ntTSL 29.81□□□□□ -0.848e-21■■■■■ 47.1
SF3B4Q15427 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 315.86■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 47
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SF3B4Q15427 CASP2-202ENST00000350623 1146 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 47
SF3B4Q15427 CASP2-204ENST00000472067 5769 ntTSL 29.94□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 47
SF3B4Q15427 CASP2-206ENST00000493642 2166 ntTSL 1 (best)9.25□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 47
SF3B4Q15427 GLS-211ENST00000469774 557 ntTSL 34.75□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 47
SF3B4Q15427 HNRNPH1-205ENST00000502632 1509 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-11■■■■■ 46.9
SF3B4Q15427 WDHD1-205ENST00000567693 2348 ntTSL 24.31□□□□□ -1.723e-6■■■■■ 46.9
SF3B4Q15427 CHKA-206ENST00000531341 524 ntTSL 319.18■□□□□ 0.666e-14■■■■■ 46.9
Retrieved 100 of 47,349 protein–RNA pairs in 4667.6 ms