Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52not detected
SF3B4Q15427 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44not detected
SF3B4Q15427 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41not detected
SF3B4Q15427 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39not detected
SF3B4Q15427 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.382e-6■■□□□ 11.7
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SF3B4Q15427 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33not detected
SF3B4Q15427 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.322e-7■■■■□ 26.5
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SF3B4Q15427 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.227e-11■■■□□ 16.9
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SF3B4Q15427 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.21e-10■■■■■ 41.9
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SF3B4Q15427 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19not detected
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SF3B4Q15427 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.182e-7■■■■□ 25.7
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SF3B4Q15427 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.166e-7■■□□□ 13.3
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SF3B4Q15427 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15not detected
SF3B4Q15427 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.148e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13not detected
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SF3B4Q15427 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.122e-8■■■■□ 25.1
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SF3B4Q15427 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05not detected
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SF3B4Q15427 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84not detected
SF3B4Q15427 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.842e-10■■■■□ 25.2
SF3B4Q15427 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84not detected
SF3B4Q15427 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84not detected
SF3B4Q15427 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84not detected
SF3B4Q15427 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83not detected
SF3B4Q15427 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83not detected
SF3B4Q15427 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83not detected
SF3B4Q15427 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83not detected
SF3B4Q15427 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82not detected
SF3B4Q15427 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82not detected
SF3B4Q15427 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82not detected
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