Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PPP1R12A-208ENST00000547330 2275 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.354e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 ACSS2-215ENST00000481971 570 ntTSL 412.72□□□□□ -0.374e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.394e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 RAB5A-202ENST00000412966 622 ntTSL 312.5□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.444e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-207ENST00000560784 717 ntTSL 511.58□□□□□ -0.564e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-207ENST00000540710 458 ntTSL 311.09□□□□□ -0.634e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-201ENST00000334660 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.654e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-202ENST00000392151 1000 ntTSL 210.81□□□□□ -0.684e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-209ENST00000561280 572 ntTSL 410.81□□□□□ -0.684e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-203ENST00000558351 766 ntTSL 59.87□□□□□ -0.834e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 ACSS2-217ENST00000488172 648 ntTSL 49.11□□□□□ -0.954e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-204ENST00000560397 568 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.974e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 RFWD3-211ENST00000575397 841 ntTSL 28.54□□□□□ -1.044e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 INTS3-209ENST00000503133 1896 ntTSL 28.38□□□□□ -1.074e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.074e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-218ENST00000485538 570 ntTSL 38.34□□□□□ -1.074e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 RNF10-205ENST00000535417 546 ntTSL 38.16□□□□□ -1.14e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-212ENST00000473060 2492 ntTSL 27.85□□□□□ -1.154e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-211ENST00000469636 1792 ntTSL 37.59□□□□□ -1.194e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-228ENST00000498469 879 ntTSL 27.27□□□□□ -1.254e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-214ENST00000477006 452 ntTSL 37.21□□□□□ -1.264e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-205ENST00000439509 584 ntTSL 36.89□□□□□ -1.314e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-208ENST00000447264 794 ntTSL 56.89□□□□□ -1.314e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-223ENST00000491357 741 ntTSL 36.53□□□□□ -1.364e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 INTS3-205ENST00000476843 3404 ntTSL 1 (best)6.44□□□□□ -1.384e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 ACSS2-204ENST00000464399 358 ntTSL 56.05□□□□□ -1.444e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.484e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.554e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.564e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.64e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 RAB5A-206ENST00000469122 918 ntTSL 24.84□□□□□ -1.634e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-217ENST00000485139 575 ntTSL 44.71□□□□□ -1.664e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-225ENST00000492027 551 ntTSL 44.7□□□□□ -1.664e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NAA15-203ENST00000468029 530 ntTSL 34.67□□□□□ -1.664e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 PPP1R12A-211ENST00000550001 631 ntTSL 54.46□□□□□ -1.74e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 PPP1R12A-206ENST00000547131 897 ntTSL 54.44□□□□□ -1.74e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 PPP1R12A-221ENST00000553081 1101 ntTSL 53.26□□□□□ -1.894e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FXR1-204ENST00000461044 601 ntTSL 42.83□□□□□ -1.964e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 AP2A2-211ENST00000527917 261 ntTSL 37.52□□□□□ -1.218e-10■□□□□ 8
SF3B4Q15427 EIF4G2-204ENST00000525606 690 ntTSL 23.63□□□□□ -1.833e-33■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-203ENST00000378054 653 ntTSL 315.92■□□□□ 0.142e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-205ENST00000468943 679 ntTSL 214.7□□□□□ -0.062e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-206ENST00000476555 580 ntTSL 313.48□□□□□ -0.252e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.652e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-204ENST00000378059 688 ntTSL 23.88□□□□□ -1.792e-12■□□□□ 8
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