Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PHB2-208ENST00000543465 1518 ntTSL 520.13■□□□□ 0.811e-323■■■□□ 17.3
SF3B4Q15427 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.571e-323■■■□□ 17.3
SF3B4Q15427 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-323■■■□□ 17.3
SF3B4Q15427 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 17.3
SF3B4Q15427 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.311e-323■■■□□ 17.3
SF3B4Q15427 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-323■■■□□ 17.3
SF3B4Q15427 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.161e-323■■■□□ 15.9
SF3B4Q15427 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.11e-323■■■□□ 15.9
SF3B4Q15427 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 514.06□□□□□ -0.161e-323■■■□□ 17.3
SF3B4Q15427 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC12.68□□□□□ -0.381e-323■■■□□ 17.3
SF3B4Q15427 TMEM107-205ENST00000449985 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.621e-323■□□□□ 10.4
SF3B4Q15427 SNORD10-201ENST00000459579 142 ntBASIC10.85□□□□□ -0.671e-323■■□□□ 13.1
SF3B4Q15427 RNU12-201ENST00000362512 150 ntBASIC10.69□□□□□ -0.71e-323■■■■■ 27.1
SF3B4Q15427 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.761e-323■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 Z93241.1-201ENST00000602478 664 ntBASIC9.82□□□□□ -0.841e-323■■■■■ 27.1
SF3B4Q15427 SNHG26-201ENST00000415611 1099 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.961e-323■□□□□ 11.2
SF3B4Q15427 RABGGTB-214ENST00000497648 1319 ntTSL 28.94□□□□□ -0.981e-323■□□□□ 11.3
SF3B4Q15427 PHB2-212ENST00000545555 309 ntTSL 58.84□□□□□ -0.991e-323■■■□□ 17.3
SF3B4Q15427 SNHG26-202ENST00000422542 1106 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.111e-323■□□□□ 11.2
SF3B4Q15427 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 36.12□□□□□ -1.431e-323■■■■□ 26
SF3B4Q15427 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 56.08□□□□□ -1.441e-323■■■■□ 26
SF3B4Q15427 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.481e-323■■□□□ 11.9
SF3B4Q15427 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)5.75□□□□□ -1.491e-323■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SNHG26-203ENST00000432668 574 ntTSL 35.55□□□□□ -1.521e-323■□□□□ 11.2
SF3B4Q15427 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 35.43□□□□□ -1.541e-323■□□□□ 10.5
SF3B4Q15427 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.04□□□□□ -1.61e-323■■■■□ 25
SF3B4Q15427 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.75□□□□□ -1.651e-323■■■□□ 14.6
SF3B4Q15427 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.51□□□□□ -1.691e-323■■■■□ 26
SF3B4Q15427 HSPA8-209ENST00000526862 504 ntTSL 34.06□□□□□ -1.761e-323■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.791e-323■□□□□ 10.5
SF3B4Q15427 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.81□□□□□ -1.81e-323■■■■□ 26
SF3B4Q15427 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.831e-323■■■□□ 18.5
SF3B4Q15427 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.851e-323■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.58□□□□□ -21e-323■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.041e-323■□□□□ 10
SF3B4Q15427 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.25□□□□□ -2.051e-323■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.081e-323■■□□□ 11.9
SF3B4Q15427 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.111e-323■■□□□ 13.2
SF3B4Q15427 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.161e-323■□□□□ 11.2
SF3B4Q15427 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.171e-323■□□□□ 9.3
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SF3B4Q15427 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.251e-323■□□□□ 11.2
SF3B4Q15427 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.281e-323■□□□□ 11.3
SF3B4Q15427 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.331e-323■□□□□ 10.4
SF3B4Q15427 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.34□□□□□ -2.361e-323■■□□□ 11.7
SF3B4Q15427 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.441e-323■□□□□ 9.5
SF3B4Q15427 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.591e-323■■■■□ 21.9
SF3B4Q15427 WDR74-208ENST00000538098 548 ntTSL 415.9■□□□□ 0.146e-130■■■■■ 189.4
SF3B4Q15427 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.046e-130■■■■■ 189.4
SF3B4Q15427 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.03□□□□□ -2.086e-130■■■■■ 189.4
SF3B4Q15427 TRAP1-208ENST00000573872 656 ntTSL 311.83□□□□□ -0.522e-91■■■■■ 93.1
SF3B4Q15427 TRAP1-214ENST00000575854 595 ntTSL 311.21□□□□□ -0.612e-91■■■■■ 93.1
SF3B4Q15427 EPB41-210ENST00000482464 675 ntTSL 215.89■□□□□ 0.132e-88■■■■■ 41.5
SF3B4Q15427 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 415.01□□□□□ -0.012e-82■■■■□ 20.2
SF3B4Q15427 RANBP1-212ENST00000467920 529 ntTSL 24.93□□□□□ -1.628e-80■■■■■ 87.8
SF3B4Q15427 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 211.99□□□□□ -0.492e-78■■■■□ 21
SF3B4Q15427 FTCD-208ENST00000480950 318 ntTSL 322.93■■□□□ 1.265e-76■■□□□ 12.1
SF3B4Q15427 FTCD-207ENST00000469240 458 ntTSL 318.39■□□□□ 0.535e-76■■□□□ 12.1
SF3B4Q15427 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.76□□□□□ -2.293e-75■■□□□ 13.1
SF3B4Q15427 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.136e-74■■■■■ 57.3
SF3B4Q15427 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC8.86□□□□□ -0.996e-74■■■■■ 57.3
SF3B4Q15427 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.446e-74■■■■■ 57.3
SF3B4Q15427 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.676e-74■■■■■ 57.3
SF3B4Q15427 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.786e-74■■■■■ 57.3
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SF3B4Q15427 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.234e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 HDAC8-205ENST00000373568 1037 ntTSL 511.84□□□□□ -0.514e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 HDAC8-216ENST00000470998 329 ntTSL 34.91□□□□□ -1.624e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.964e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.69□□□□□ -2.37e-73■■□□□ 12.6
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SF3B4Q15427 RUVBL1-203ENST00000472125 913 ntTSL 39.77□□□□□ -0.854e-71■■■■■ 209.9
SF3B4Q15427 RUVBL1-208ENST00000585057 1113 ntTSL 39.58□□□□□ -0.884e-71■■■■■ 209.9
SF3B4Q15427 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.62□□□□□ -1.834e-71■■■■■ 209.9
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SF3B4Q15427 UBE2D3-229ENST00000510129 582 ntTSL 319.53■□□□□ 0.723e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.713e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-216ENST00000503742 1977 ntTSL 1 (best)18.64■□□□□ 0.583e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-220ENST00000505307 743 ntTSL 518.33■□□□□ 0.523e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-215ENST00000503418 662 ntTSL 417.72■□□□□ 0.433e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-213ENST00000502690 599 ntTSL 415.43■□□□□ 0.063e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.143e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-228ENST00000508974 568 ntTSL 413.43□□□□□ -0.263e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-231ENST00000513098 702 ntTSL 311.5□□□□□ -0.573e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-232ENST00000514755 593 ntTSL 49.89□□□□□ -0.833e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-212ENST00000502563 680 ntTSL 39.77□□□□□ -0.853e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.873e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.913e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-206ENST00000357194 660 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.913e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-227ENST00000508818 584 ntTSL 29.27□□□□□ -0.933e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.043e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-223ENST00000508249 604 ntTSL 48.36□□□□□ -1.073e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.193e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-222ENST00000508238 547 ntTSL 47.26□□□□□ -1.253e-70■■■■■ 60.5
SF3B4Q15427 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.83□□□□□ -1.166e-70■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.69□□□□□ -1.666e-70■■■■■ 26.9
SF3B4Q15427 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 34.34□□□□□ -1.716e-70■■■■■ 29.1
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