RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613953.4

TPI1-210, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,460 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-210ENST00000613953 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.71■■■■■ 6.99
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TPI1-210ENST00000613953 SMARCA2P51531 1590 aa45.59■■■■■ 4.89
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TPI1-210ENST00000613953 WIZO95785 1651 aa44.67■■■■■ 4.74
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TPI1-210ENST00000613953 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.4■■■■■ 4.7
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TPI1-210ENST00000613953 CFTRP13569 1480 aa43.98■■■■■ 4.63
TPI1-210ENST00000613953 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.91■■■■■ 4.62
TPI1-210ENST00000613953 WDR62O43379 1518 aa43.91■■■■■ 4.62
TPI1-210ENST00000613953 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.9■■■■■ 4.62
TPI1-210ENST00000613953 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.66■■■■■ 4.58
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TPI1-210ENST00000613953 PRDM2Q13029 1718 aa43.51■■■■■ 4.56
TPI1-210ENST00000613953 TOPBP1Q92547 1522 aa43.1■■■■■ 4.49
TPI1-210ENST00000613953 ABCC8Q09428 1581 aa43.04■■■■■ 4.48
TPI1-210ENST00000613953 IFT140Q96RY7 1462 aa43.03■■■■■ 4.48
TPI1-210ENST00000613953 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.98■■■■■ 4.47
TPI1-210ENST00000613953 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
TPI1-210ENST00000613953 OSCARQ8IYS5 282 aa42.83■■■■■ 4.45
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TPI1-210ENST00000613953 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.46■■■■■ 4.39
TPI1-210ENST00000613953 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
TPI1-210ENST00000613953 WDR97A6NE52 1622 aa42.31■■■■■ 4.36
TPI1-210ENST00000613953 CHD1O14646 1710 aa42.27■■■■■ 4.36
TPI1-210ENST00000613953 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.24■■■■■ 4.35
TPI1-210ENST00000613953 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.24■■■■■ 4.35
TPI1-210ENST00000613953 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.24■■■■■ 4.35
TPI1-210ENST00000613953 ARHGEF11O15085 1522 aa42.18■■■■■ 4.34
TPI1-210ENST00000613953 FBLN2P98095 1184 aa42.17■■■■■ 4.34
TPI1-210ENST00000613953 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.15■■■■■ 4.34
TPI1-210ENST00000613953 GRIN2BQ13224 1484 aa42.1■■■■■ 4.33
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TPI1-210ENST00000613953 SYNJ2O15056 1496 aa41.93■■■■■ 4.3
TPI1-210ENST00000613953 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.92■■■■■ 4.3
TPI1-210ENST00000613953 PBRM1Q86U86 1689 aa41.91■■■■■ 4.3
TPI1-210ENST00000613953 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.91■■■■■ 4.3
TPI1-210ENST00000613953 TOP2BQ02880 1626 aa41.9■■■■■ 4.3
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TPI1-210ENST00000613953 ADAMTS12P58397 1594 aa41.58■■■■■ 4.25
TPI1-210ENST00000613953 GRIN2AQ12879 1464 aa41.56■■■■■ 4.24
TPI1-210ENST00000613953 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.5■■■■■ 4.23
TPI1-210ENST00000613953 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.48■■■■■ 4.23
TPI1-210ENST00000613953 NUP160Q12769 1436 aa41.42■■■■■ 4.22
TPI1-210ENST00000613953 CEP170Q5SW79 1584 aa41.38■■■■■ 4.21
TPI1-210ENST00000613953 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
TPI1-210ENST00000613953 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.19■■■■■ 4.19
TPI1-210ENST00000613953 SHROOM2Q13796 1616 aa41.18■■■■■ 4.18
TPI1-210ENST00000613953 KIF27Q86VH2 1401 aa41.1■■■■■ 4.17
TPI1-210ENST00000613953 IGF1RP08069 1367 aa41.03■■■■■ 4.16
TPI1-210ENST00000613953 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41■■■■■ 4.15
TPI1-210ENST00000613953 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
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