Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAM5Q96HS1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGAM5Q96HS1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAM5Q96HS1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM5Q96HS1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM5Q96HS1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM5Q96HS1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms