RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.75■■■■■ 6.68
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PXDC1-202ENST00000380283 ABCC9O60706 1549 aa47.17■■■■■ 5.14
PXDC1-202ENST00000380283 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.1■■■■■ 5.13
PXDC1-202ENST00000380283 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.88■■■■■ 5.1
PXDC1-202ENST00000380283 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.42■■■■■ 5.02
PXDC1-202ENST00000380283 NACADO15069 1562 aa46.23■■■■■ 4.99
PXDC1-202ENST00000380283 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.2■■■■■ 4.99
PXDC1-202ENST00000380283 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.89■■■■■ 4.94
PXDC1-202ENST00000380283 SCRIBQ14160 1630 aa45.57■■■■■ 4.89
PXDC1-202ENST00000380283 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.94■■■■■ 4.79
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PXDC1-202ENST00000380283 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.5■■■■■ 4.72
PXDC1-202ENST00000380283 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.16■■■■■ 4.66
PXDC1-202ENST00000380283 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.99■■■■■ 4.63
PXDC1-202ENST00000380283 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
PXDC1-202ENST00000380283 HRCP23327 699 aa43.85■■■■■ 4.61
PXDC1-202ENST00000380283 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.85■■■■■ 4.61
PXDC1-202ENST00000380283 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.61
PXDC1-202ENST00000380283 SMARCA4P51532 1647 aa43.65■■■■■ 4.58
PXDC1-202ENST00000380283 WIZO95785 1651 aa43.47■■■■■ 4.55
PXDC1-202ENST00000380283 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
PXDC1-202ENST00000380283 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.19■■■■■ 4.5
PXDC1-202ENST00000380283 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.12■■■■■ 4.49
PXDC1-202ENST00000380283 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.04■■■■■ 4.48
PXDC1-202ENST00000380283 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
PXDC1-202ENST00000380283 SMARCA2P51531 1590 aa42.97■■■■■ 4.47
PXDC1-202ENST00000380283 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
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PXDC1-202ENST00000380283 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.65■■■■■ 4.42
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PXDC1-202ENST00000380283 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.6■■■■■ 4.41
PXDC1-202ENST00000380283 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.58■■■■■ 4.41
PXDC1-202ENST00000380283 HMGXB3Q12766 1538 aa42.58■■■■■ 4.41
PXDC1-202ENST00000380283 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
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PXDC1-202ENST00000380283 TRIM41Q8WV44 630 aa41.71■■■■■ 4.27
PXDC1-202ENST00000380283 CFTRP13569 1480 aa41.7■■■■■ 4.27
PXDC1-202ENST00000380283 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.63■■■■■ 4.25
PXDC1-202ENST00000380283 ABCC8Q09428 1581 aa41.61■■■■■ 4.25
PXDC1-202ENST00000380283 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.22
PXDC1-202ENST00000380283 PRDM2Q13029 1718 aa41.35■■■■■ 4.21
PXDC1-202ENST00000380283 NESP48681 1621 aa41.34■■■■■ 4.21
PXDC1-202ENST00000380283 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.27■■■■■ 4.2
PXDC1-202ENST00000380283 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
PXDC1-202ENST00000380283 SYNJ1O43426 1573 aa41.19■■■■■ 4.18
PXDC1-202ENST00000380283 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.15■■■■■ 4.18
PXDC1-202ENST00000380283 TOP2BQ02880 1626 aa41.03■■■■■ 4.16
PXDC1-202ENST00000380283 CUX1P39880 1505 aa41■■■■■ 4.15
PXDC1-202ENST00000380283 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41■■■■■ 4.15
PXDC1-202ENST00000380283 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.96■■■■■ 4.15
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PXDC1-202ENST00000380283 SOGA1O94964 1423 aa40.81■■■■■ 4.12
PXDC1-202ENST00000380283 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.77■■■■■ 4.12
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PXDC1-202ENST00000380283 TOPBP1Q92547 1522 aa40.66■■■■■ 4.1
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PXDC1-202ENST00000380283 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.6■■■■■ 4.09
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PXDC1-202ENST00000380283 ERCC6Q03468 1493 aa40.46■■■■■ 4.07
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PXDC1-202ENST00000380283 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
PXDC1-202ENST00000380283 KIF27Q86VH2 1401 aa40.36■■■■■ 4.05
PXDC1-202ENST00000380283 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
PXDC1-202ENST00000380283 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.35■■■■■ 4.05
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PXDC1-202ENST00000380283 WDR62O43379 1518 aa40.23■■■■■ 4.03
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PXDC1-202ENST00000380283 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.09■■■■■ 4.01
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PXDC1-202ENST00000380283 NEUROD1Q13562 356 aa40■■■■□ 3.99
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PXDC1-202ENST00000380283 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.98■■■■□ 3.99
PXDC1-202ENST00000380283 IFT140Q96RY7 1462 aa39.93■■■■□ 3.98
PXDC1-202ENST00000380283 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.88■■■■□ 3.97
PXDC1-202ENST00000380283 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.88■■■■□ 3.97
PXDC1-202ENST00000380283 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.87■■■■□ 3.97
PXDC1-202ENST00000380283 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
PXDC1-202ENST00000380283 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.85■■■■□ 3.97
PXDC1-202ENST00000380283 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.78■■■■□ 3.966e-8■■■■□ 22.5
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
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