RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613141.1

PGM5P2-201, Transcript of phosphoglucomutase 5 pseudogene 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGM5P2, Length 1,980 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM5P2-201ENST00000613141 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.97■■■■■ 6.87
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PGM5P2-201ENST00000613141 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.75■■■■■ 5.23
PGM5P2-201ENST00000613141 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.66■■■■■ 5.22
PGM5P2-201ENST00000613141 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.16■■■■■ 5.14
PGM5P2-201ENST00000613141 ABCC9O60706 1549 aa47.14■■■■■ 5.14
PGM5P2-201ENST00000613141 NACADO15069 1562 aa46.73■■■■■ 5.07
PGM5P2-201ENST00000613141 SCRIBQ14160 1630 aa46.34■■■■■ 5.01
PGM5P2-201ENST00000613141 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.2■■■■■ 4.99
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PGM5P2-201ENST00000613141 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.19■■■■■ 4.82
PGM5P2-201ENST00000613141 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.02■■■■■ 4.8
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PGM5P2-201ENST00000613141 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.82■■■■■ 4.77
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PGM5P2-201ENST00000613141 SMARCA4P51532 1647 aa44.45■■■■■ 4.71
PGM5P2-201ENST00000613141 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.43■■■■■ 4.7
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PGM5P2-201ENST00000613141 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.89■■■■■ 4.62
PGM5P2-201ENST00000613141 SMARCA2P51531 1590 aa43.63■■■■■ 4.57
PGM5P2-201ENST00000613141 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.6■■■■■ 4.57
PGM5P2-201ENST00000613141 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.59■■■■■ 4.57
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PGM5P2-201ENST00000613141 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
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PGM5P2-201ENST00000613141 NCAPD3P42695 1498 aa43.14■■■■■ 4.5
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PGM5P2-201ENST00000613141 ABCC8Q09428 1581 aa42.83■■■■■ 4.45
PGM5P2-201ENST00000613141 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.76■■■■■ 4.44
PGM5P2-201ENST00000613141 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.66■■■■■ 4.42
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PGM5P2-201ENST00000613141 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.5■■■■■ 4.39
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PGM5P2-201ENST00000613141 SYNJ1O43426 1573 aa42.3■■■■■ 4.36
PGM5P2-201ENST00000613141 SOGA1O94964 1423 aa42.15■■■■■ 4.34
PGM5P2-201ENST00000613141 EEA1Q15075 1411 aa42.15■■■■■ 4.34
PGM5P2-201ENST00000613141 PRDM2Q13029 1718 aa42.11■■■■■ 4.33
PGM5P2-201ENST00000613141 TOP2BQ02880 1626 aa42.09■■■■■ 4.33
PGM5P2-201ENST00000613141 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.08■■■■■ 4.33
PGM5P2-201ENST00000613141 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.03■■■■■ 4.32
PGM5P2-201ENST00000613141 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.96■■■■■ 4.31
PGM5P2-201ENST00000613141 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.94■■■■■ 4.3
PGM5P2-201ENST00000613141 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.9■■■■■ 4.3
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PGM5P2-201ENST00000613141 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.61■■■■■ 4.25
PGM5P2-201ENST00000613141 GOLGA3Q08378 1498 aa41.6■■■■■ 4.25
PGM5P2-201ENST00000613141 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.58■■■■■ 4.25
PGM5P2-201ENST00000613141 KIF21BO75037 1637 aa41.58■■■■■ 4.25
PGM5P2-201ENST00000613141 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.57■■■■■ 4.25
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PGM5P2-201ENST00000613141 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.33■■■■■ 4.21
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PGM5P2-201ENST00000613141 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.32■■■■■ 4.21
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PGM5P2-201ENST00000613141 PRXQ9BXM0 1461 aa41.24■■■■■ 4.19
PGM5P2-201ENST00000613141 TOPBP1Q92547 1522 aa41.22■■■■■ 4.19
PGM5P2-201ENST00000613141 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.21■■■■■ 4.19
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PGM5P2-201ENST00000613141 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
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PGM5P2-201ENST00000613141 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.02
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