Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPG2Q9UBF2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPG2Q9UBF2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPG2Q9UBF2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPG2Q9UBF2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPG2Q9UBF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPG2Q9UBF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPG2Q9UBF2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPG2Q9UBF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPG2Q9UBF2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPG2Q9UBF2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPG2Q9UBF2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPG2Q9UBF2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPG2Q9UBF2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPG2Q9UBF2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPG2Q9UBF2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPG2Q9UBF2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPG2Q9UBF2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPG2Q9UBF2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPG2Q9UBF2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPG2Q9UBF2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPG2Q9UBF2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPG2Q9UBF2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPG2Q9UBF2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms