Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
COPG2Q9UBF2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
COPG2Q9UBF2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
COPG2Q9UBF2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
COPG2Q9UBF2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
COPG2Q9UBF2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
COPG2Q9UBF2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
COPG2Q9UBF2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
COPG2Q9UBF2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
COPG2Q9UBF2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
COPG2Q9UBF2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
COPG2Q9UBF2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
COPG2Q9UBF2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
COPG2Q9UBF2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
COPG2Q9UBF2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
COPG2Q9UBF2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
COPG2Q9UBF2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
COPG2Q9UBF2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
COPG2Q9UBF2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
COPG2Q9UBF2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
COPG2Q9UBF2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COPG2Q9UBF2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COPG2Q9UBF2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
COPG2Q9UBF2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
COPG2Q9UBF2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
COPG2Q9UBF2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
COPG2Q9UBF2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
COPG2Q9UBF2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
COPG2Q9UBF2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
COPG2Q9UBF2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COPG2Q9UBF2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COPG2Q9UBF2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
COPG2Q9UBF2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
COPG2Q9UBF2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
COPG2Q9UBF2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COPG2Q9UBF2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
COPG2Q9UBF2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COPG2Q9UBF2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
COPG2Q9UBF2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COPG2Q9UBF2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COPG2Q9UBF2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
COPG2Q9UBF2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
COPG2Q9UBF2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COPG2Q9UBF2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COPG2Q9UBF2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COPG2Q9UBF2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COPG2Q9UBF2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COPG2Q9UBF2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COPG2Q9UBF2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COPG2Q9UBF2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COPG2Q9UBF2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COPG2Q9UBF2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COPG2Q9UBF2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COPG2Q9UBF2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COPG2Q9UBF2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COPG2Q9UBF2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COPG2Q9UBF2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COPG2Q9UBF2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COPG2Q9UBF2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COPG2Q9UBF2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COPG2Q9UBF2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COPG2Q9UBF2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COPG2Q9UBF2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COPG2Q9UBF2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COPG2Q9UBF2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COPG2Q9UBF2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COPG2Q9UBF2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPG2Q9UBF2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPG2Q9UBF2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPG2Q9UBF2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPG2Q9UBF2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPG2Q9UBF2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPG2Q9UBF2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COPG2Q9UBF2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COPG2Q9UBF2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COPG2Q9UBF2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COPG2Q9UBF2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COPG2Q9UBF2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COPG2Q9UBF2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COPG2Q9UBF2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COPG2Q9UBF2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COPG2Q9UBF2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COPG2Q9UBF2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COPG2Q9UBF2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COPG2Q9UBF2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COPG2Q9UBF2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COPG2Q9UBF2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COPG2Q9UBF2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COPG2Q9UBF2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COPG2Q9UBF2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COPG2Q9UBF2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COPG2Q9UBF2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COPG2Q9UBF2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COPG2Q9UBF2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COPG2Q9UBF2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
COPG2Q9UBF2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COPG2Q9UBF2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COPG2Q9UBF2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COPG2Q9UBF2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COPG2Q9UBF2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms