Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNQ1DNQ9H478 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNQ1DNQ9H478 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNQ1DNQ9H478 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNQ1DNQ9H478 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNQ1DNQ9H478 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNQ1DNQ9H478 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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