RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284292.10

NRGN-201, Transcript of neurogranin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NRGN, Length 1,306 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRGN-201ENST00000284292 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.19■■■■■ 8.99
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NRGN-201ENST00000284292 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa59.85■■■■■ 7.17
NRGN-201ENST00000284292 NACADO15069 1562 aa59.71■■■■■ 7.15
NRGN-201ENST00000284292 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.33■■■■■ 7.09
NRGN-201ENST00000284292 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.28■■■■■ 7.08
NRGN-201ENST00000284292 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.27■■■■■ 7.08
NRGN-201ENST00000284292 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.92■■■■■ 7.02
NRGN-201ENST00000284292 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.71■■■■■ 6.99
NRGN-201ENST00000284292 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.12■■■■■ 6.89
NRGN-201ENST00000284292 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.04■■■■■ 6.88
NRGN-201ENST00000284292 SCRIBQ14160 1630 aa57.89■■■■■ 6.86
NRGN-201ENST00000284292 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.43■■■■■ 6.78
NRGN-201ENST00000284292 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.35■■■■■ 6.77
NRGN-201ENST00000284292 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.56■■■■■ 6.65
NRGN-201ENST00000284292 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.41■■■■■ 6.62
NRGN-201ENST00000284292 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.99■■■■■ 6.55
NRGN-201ENST00000284292 SMARCA4P51532 1647 aa55.37■■■■■ 6.45
NRGN-201ENST00000284292 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.21■■■■■ 6.43
NRGN-201ENST00000284292 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.05■■■■■ 6.4
NRGN-201ENST00000284292 NCAPD3P42695 1498 aa55.04■■■■■ 6.4
NRGN-201ENST00000284292 SMARCA2P51531 1590 aa55■■■■■ 6.39
NRGN-201ENST00000284292 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.87■■■■■ 6.37
NRGN-201ENST00000284292 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.84■■■■■ 6.37
NRGN-201ENST00000284292 HMGXB3Q12766 1538 aa54.84■■■■■ 6.37
NRGN-201ENST00000284292 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.58■■■■■ 6.33
NRGN-201ENST00000284292 WIZO95785 1651 aa54.33■■■■■ 6.29
NRGN-201ENST00000284292 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.08■■■■■ 6.25
NRGN-201ENST00000284292 NESP48681 1621 aa53.85■■■■■ 6.21
NRGN-201ENST00000284292 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.71■■■■■ 6.19
NRGN-201ENST00000284292 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.7■■■■■ 6.19
NRGN-201ENST00000284292 ERCC6Q03468 1493 aa53.67■■■■■ 6.18
NRGN-201ENST00000284292 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.38■■■■■ 6.14
NRGN-201ENST00000284292 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.35■■■■■ 6.13
NRGN-201ENST00000284292 CUX2O14529 1486 aa53.26■■■■■ 6.12
NRGN-201ENST00000284292 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.23■■■■■ 6.11
NRGN-201ENST00000284292 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.2■■■■■ 6.11
NRGN-201ENST00000284292 CFTRP13569 1480 aa53.06■■■■■ 6.08
NRGN-201ENST00000284292 CCDC88BA6NC98 1476 aa53■■■■■ 6.08
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NRGN-201ENST00000284292 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.82■■■■■ 6.05
NRGN-201ENST00000284292 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.79■■■■■ 6.04
NRGN-201ENST00000284292 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.79■■■■■ 6.04
NRGN-201ENST00000284292 WDR62O43379 1518 aa52.69■■■■■ 6.02
NRGN-201ENST00000284292 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.36■■■■■ 5.97
NRGN-201ENST00000284292 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.36■■■■■ 5.97
NRGN-201ENST00000284292 TOPBP1Q92547 1522 aa51.98■■■■■ 5.91
NRGN-201ENST00000284292 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.93■■■■■ 5.9
NRGN-201ENST00000284292 ABCC8Q09428 1581 aa51.9■■■■■ 5.9
NRGN-201ENST00000284292 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.83■■■■■ 5.89
NRGN-201ENST00000284292 IFT140Q96RY7 1462 aa51.69■■■■■ 5.86
NRGN-201ENST00000284292 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.51■■■■■ 5.84
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NRGN-201ENST00000284292 CUX1P39880 1505 aa51.51■■■■■ 5.84
NRGN-201ENST00000284292 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.51■■■■■ 5.84
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NRGN-201ENST00000284292 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.35■■■■■ 5.81
NRGN-201ENST00000284292 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.26■■■■■ 5.8
NRGN-201ENST00000284292 SOGA1O94964 1423 aa51.21■■■■■ 5.79
NRGN-201ENST00000284292 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.12■■■■■ 5.772e-8■■■■■ 43.9
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NRGN-201ENST00000284292 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.07■■■■■ 5.77
NRGN-201ENST00000284292 TOP2BQ02880 1626 aa51.02■■■■■ 5.76
NRGN-201ENST00000284292 SYNJ1O43426 1573 aa51.01■■■■■ 5.76
NRGN-201ENST00000284292 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51■■■■■ 5.75
NRGN-201ENST00000284292 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.95■■■■■ 5.75
NRGN-201ENST00000284292 CHD1O14646 1710 aa50.85■■■■■ 5.73
NRGN-201ENST00000284292 OSCARQ8IYS5 282 aa50.85■■■■■ 5.73
NRGN-201ENST00000284292 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.84■■■■■ 5.73
NRGN-201ENST00000284292 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.77■■■■■ 5.72
NRGN-201ENST00000284292 PBRM1Q86U86 1689 aa50.76■■■■■ 5.72
NRGN-201ENST00000284292 GRIN2BQ13224 1484 aa50.7■■■■■ 5.71
NRGN-201ENST00000284292 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.7■■■■■ 5.71
NRGN-201ENST00000284292 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.66■■■■■ 5.7
NRGN-201ENST00000284292 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.62■■■■■ 5.69
NRGN-201ENST00000284292 FBLN2P98095 1184 aa50.44■■■■■ 5.67
NRGN-201ENST00000284292 SYNJ2O15056 1496 aa50.41■■■■■ 5.66
NRGN-201ENST00000284292 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.3■■■■■ 5.64
NRGN-201ENST00000284292 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.3■■■■■ 5.64
NRGN-201ENST00000284292 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.3■■■■■ 5.64
NRGN-201ENST00000284292 ADAMTS12P58397 1594 aa50.28■■■■■ 5.64
NRGN-201ENST00000284292 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.28■■■■■ 5.64
NRGN-201ENST00000284292 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.23■■■■■ 5.63
NRGN-201ENST00000284292 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.22■■■■■ 5.63
NRGN-201ENST00000284292 ARHGEF11O15085 1522 aa50.2■■■■■ 5.63
NRGN-201ENST00000284292 GRIN2AQ12879 1464 aa50.07■■■■■ 5.61
NRGN-201ENST00000284292 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.06■■■■■ 5.6
NRGN-201ENST00000284292 TRIM41Q8WV44 630 aa49.98■■■■■ 5.59
NRGN-201ENST00000284292 KIF27Q86VH2 1401 aa49.93■■■■■ 5.58
NRGN-201ENST00000284292 CEP170Q5SW79 1584 aa49.9■■■■■ 5.58
NRGN-201ENST00000284292 NUP160Q12769 1436 aa49.87■■■■■ 5.57
NRGN-201ENST00000284292 CUL7Q14999 1698 aa49.79■■■■■ 5.56
NRGN-201ENST00000284292 ARAP1Q96P48 1450 aa49.78■■■■■ 5.56
NRGN-201ENST00000284292 IGF1RP08069 1367 aa49.74■■■■■ 5.55
NRGN-201ENST00000284292 SHROOM2Q13796 1616 aa49.63■■■■■ 5.53
NRGN-201ENST00000284292 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.58■■■■■ 5.53
NRGN-201ENST00000284292 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.57■■■■■ 5.53
NRGN-201ENST00000284292 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.5■■■■■ 5.51
NRGN-201ENST00000284292 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.43■■■■■ 5.5
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