Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA6

TSSK6, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK6Q9BXA6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSSK6Q9BXA6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSSK6Q9BXA6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSSK6Q9BXA6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSSK6Q9BXA6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK6Q9BXA6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK6Q9BXA6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK6Q9BXA6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK6Q9BXA6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK6Q9BXA6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK6Q9BXA6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK6Q9BXA6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK6Q9BXA6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSSK6Q9BXA6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK6Q9BXA6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK6Q9BXA6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSSK6Q9BXA6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK6Q9BXA6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK6Q9BXA6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK6Q9BXA6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK6Q9BXA6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK6Q9BXA6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK6Q9BXA6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSSK6Q9BXA6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSSK6Q9BXA6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSSK6Q9BXA6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSSK6Q9BXA6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK6Q9BXA6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK6Q9BXA6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK6Q9BXA6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK6Q9BXA6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK6Q9BXA6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK6Q9BXA6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms