Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ9

BBS1, Bardet-Biedl syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1Q8NFJ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBS1Q8NFJ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS1Q8NFJ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS1Q8NFJ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS1Q8NFJ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS1Q8NFJ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS1Q8NFJ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS1Q8NFJ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS1Q8NFJ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS1Q8NFJ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS1Q8NFJ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS1Q8NFJ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS1Q8NFJ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS1Q8NFJ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBS1Q8NFJ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBS1Q8NFJ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BBS1Q8NFJ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS1Q8NFJ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BBS1Q8NFJ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BBS1Q8NFJ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS1Q8NFJ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS1Q8NFJ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS1Q8NFJ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS1Q8NFJ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS1Q8NFJ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS1Q8NFJ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS1Q8NFJ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms