Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MCTP1Q6DN14 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
MCTP1Q6DN14 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MCTP1Q6DN14 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCTP1Q6DN14 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCTP1Q6DN14 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MCTP1Q6DN14 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MCTP1Q6DN14 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MCTP1Q6DN14 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
MCTP1Q6DN14 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MCTP1Q6DN14 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
MCTP1Q6DN14 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MCTP1Q6DN14 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MCTP1Q6DN14 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MCTP1Q6DN14 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MCTP1Q6DN14 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MCTP1Q6DN14 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MCTP1Q6DN14 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MCTP1Q6DN14 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MCTP1Q6DN14 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MCTP1Q6DN14 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MCTP1Q6DN14 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MCTP1Q6DN14 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MCTP1Q6DN14 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MCTP1Q6DN14 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MCTP1Q6DN14 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
MCTP1Q6DN14 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MCTP1Q6DN14 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MCTP1Q6DN14 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MCTP1Q6DN14 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MCTP1Q6DN14 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MCTP1Q6DN14 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MCTP1Q6DN14 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MCTP1Q6DN14 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MCTP1Q6DN14 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MCTP1Q6DN14 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MCTP1Q6DN14 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MCTP1Q6DN14 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MCTP1Q6DN14 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MCTP1Q6DN14 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MCTP1Q6DN14 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MCTP1Q6DN14 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MCTP1Q6DN14 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MCTP1Q6DN14 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MCTP1Q6DN14 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MCTP1Q6DN14 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MCTP1Q6DN14 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MCTP1Q6DN14 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MCTP1Q6DN14 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
MCTP1Q6DN14 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MCTP1Q6DN14 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
MCTP1Q6DN14 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MCTP1Q6DN14 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms