Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
MCTP1Q6DN14 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MCTP1Q6DN14 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
MCTP1Q6DN14 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
MCTP1Q6DN14 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
MCTP1Q6DN14 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
MCTP1Q6DN14 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MCTP1Q6DN14 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
MCTP1Q6DN14 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
MCTP1Q6DN14 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
MCTP1Q6DN14 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
MCTP1Q6DN14 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MCTP1Q6DN14 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MCTP1Q6DN14 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MCTP1Q6DN14 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
MCTP1Q6DN14 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
MCTP1Q6DN14 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MCTP1Q6DN14 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MCTP1Q6DN14 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
MCTP1Q6DN14 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
MCTP1Q6DN14 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
MCTP1Q6DN14 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MCTP1Q6DN14 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
MCTP1Q6DN14 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
MCTP1Q6DN14 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MCTP1Q6DN14 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
MCTP1Q6DN14 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
MCTP1Q6DN14 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
MCTP1Q6DN14 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MCTP1Q6DN14 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
MCTP1Q6DN14 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
MCTP1Q6DN14 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MCTP1Q6DN14 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MCTP1Q6DN14 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MCTP1Q6DN14 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MCTP1Q6DN14 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MCTP1Q6DN14 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MCTP1Q6DN14 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
MCTP1Q6DN14 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MCTP1Q6DN14 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MCTP1Q6DN14 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
MCTP1Q6DN14 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MCTP1Q6DN14 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
MCTP1Q6DN14 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
MCTP1Q6DN14 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MCTP1Q6DN14 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MCTP1Q6DN14 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MCTP1Q6DN14 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MCTP1Q6DN14 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MCTP1Q6DN14 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MCTP1Q6DN14 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MCTP1Q6DN14 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MCTP1Q6DN14 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MCTP1Q6DN14 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MCTP1Q6DN14 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
MCTP1Q6DN14 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MCTP1Q6DN14 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MCTP1Q6DN14 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
MCTP1Q6DN14 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
MCTP1Q6DN14 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MCTP1Q6DN14 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MCTP1Q6DN14 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MCTP1Q6DN14 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MCTP1Q6DN14 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MCTP1Q6DN14 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
MCTP1Q6DN14 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MCTP1Q6DN14 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MCTP1Q6DN14 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MCTP1Q6DN14 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MCTP1Q6DN14 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MCTP1Q6DN14 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MCTP1Q6DN14 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MCTP1Q6DN14 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MCTP1Q6DN14 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MCTP1Q6DN14 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MCTP1Q6DN14 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
MCTP1Q6DN14 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MCTP1Q6DN14 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MCTP1Q6DN14 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MCTP1Q6DN14 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MCTP1Q6DN14 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MCTP1Q6DN14 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MCTP1Q6DN14 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MCTP1Q6DN14 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MCTP1Q6DN14 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MCTP1Q6DN14 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MCTP1Q6DN14 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MCTP1Q6DN14 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MCTP1Q6DN14 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MCTP1Q6DN14 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MCTP1Q6DN14 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MCTP1Q6DN14 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MCTP1Q6DN14 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MCTP1Q6DN14 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MCTP1Q6DN14 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MCTP1Q6DN14 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MCTP1Q6DN14 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MCTP1Q6DN14 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MCTP1Q6DN14 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MCTP1Q6DN14 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms