Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKP1Q13835 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PKP1Q13835 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PKP1Q13835 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKP1Q13835 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKP1Q13835 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKP1Q13835 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKP1Q13835 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PKP1Q13835 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKP1Q13835 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PKP1Q13835 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKP1Q13835 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PKP1Q13835 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PKP1Q13835 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PKP1Q13835 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PKP1Q13835 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PKP1Q13835 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PKP1Q13835 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PKP1Q13835 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PKP1Q13835 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PKP1Q13835 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PKP1Q13835 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PKP1Q13835 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PKP1Q13835 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PKP1Q13835 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PKP1Q13835 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PKP1Q13835 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PKP1Q13835 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PKP1Q13835 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PKP1Q13835 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PKP1Q13835 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PKP1Q13835 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
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