Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPRR1AP35321 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPRR1AP35321 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPRR1AP35321 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPRR1AP35321 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPRR1AP35321 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPRR1AP35321 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.8 ms