Protein–RNA interactions for Protein: P16402

HIST1H1D, Histone H1.3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1DP16402 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIST1H1DP16402 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST1H1DP16402 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST1H1DP16402 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST1H1DP16402 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST1H1DP16402 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST1H1DP16402 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST1H1DP16402 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIST1H1DP16402 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIST1H1DP16402 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIST1H1DP16402 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIST1H1DP16402 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HIST1H1DP16402 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIST1H1DP16402 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIST1H1DP16402 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIST1H1DP16402 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIST1H1DP16402 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST1H1DP16402 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIST1H1DP16402 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIST1H1DP16402 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H1DP16402 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H1DP16402 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H1DP16402 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIST1H1DP16402 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST1H1DP16402 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST1H1DP16402 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST1H1DP16402 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H1DP16402 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIST1H1DP16402 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST1H1DP16402 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST1H1DP16402 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms