RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623591.1

AC006077.2-201, humanhuman

BASIC

Gene AC006077.2, Length 457 nt, Biotype TEC.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC006077.2-201ENST00000623591 NISCHQ9Y2I1 1504 aa74.06■■■■■ 9.45
AC006077.2-201ENST00000623591 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa66.32■■■■■ 8.21
AC006077.2-201ENST00000623591 ABCC9O60706 1549 aa65.64■■■■■ 8.1
AC006077.2-201ENST00000623591 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa62.86■■■■■ 7.65
AC006077.2-201ENST00000623591 NACADO15069 1562 aa62.58■■■■■ 7.61
AC006077.2-201ENST00000623591 DCAF8L2P0C7V8 631 aa62.13■■■■■ 7.54
AC006077.2-201ENST00000623591 MYO15BQ96JP2 1530 aa61.97■■■■■ 7.51
AC006077.2-201ENST00000623591 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP61.47■■■■■ 7.43
AC006077.2-201ENST00000623591 UNC13AQ9UPW8 1703 aa61.41■■■■■ 7.42
AC006077.2-201ENST00000623591 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa61.32■■■■■ 7.41
AC006077.2-201ENST00000623591 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP61.15■■■■■ 7.38
AC006077.2-201ENST00000623591 DNAJC5BQ9UF47 199 aa61.14■■■■■ 7.38
AC006077.2-201ENST00000623591 BICRAQ9NZM4 1560 aa60.96■■■■■ 7.35
AC006077.2-201ENST00000623591 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60.35■■■■■ 7.25
AC006077.2-201ENST00000623591 SCRIBQ14160 1630 aa60.27■■■■■ 7.24
AC006077.2-201ENST00000623591 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP59.42■■■■■ 7.1
AC006077.2-201ENST00000623591 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa59.4■■■■■ 7.1
AC006077.2-201ENST00000623591 CECR2Q9BXF3 1484 aa59.14■■■■■ 7.06
AC006077.2-201ENST00000623591 NCAPD3P42695 1498 aa57.76■■■■■ 6.84
AC006077.2-201ENST00000623591 SMARCA4P51532 1647 aa57.65■■■■■ 6.82
AC006077.2-201ENST00000623591 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa57.58■■■■■ 6.81
AC006077.2-201ENST00000623591 SMARCA2P51531 1590 aa57.51■■■■■ 6.8
AC006077.2-201ENST00000623591 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP57.48■■■■■ 6.79
AC006077.2-201ENST00000623591 HMGXB3Q12766 1538 aa57.37■■■■■ 6.77
AC006077.2-201ENST00000623591 PEG3Q9GZU2 1588 aa57.18■■■■■ 6.74
AC006077.2-201ENST00000623591 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP57.03■■■■■ 6.72
AC006077.2-201ENST00000623591 MROH2BQ7Z745 1585 aa57■■■■■ 6.72
AC006077.2-201ENST00000623591 ERCC6Q03468 1493 aa56.68■■■■■ 6.66
AC006077.2-201ENST00000623591 CUX2O14529 1486 aa56.53■■■■■ 6.64
AC006077.2-201ENST00000623591 NESP48681 1621 aa56.52■■■■■ 6.64
AC006077.2-201ENST00000623591 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa56.38■■■■■ 6.62
AC006077.2-201ENST00000623591 WIZO95785 1651 aa56.34■■■■■ 6.61
AC006077.2-201ENST00000623591 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP56.03■■■■■ 6.56
AC006077.2-201ENST00000623591 PDS5BQ9NTI5 1447 aa56.02■■■■■ 6.56
AC006077.2-201ENST00000623591 CADPSQ9ULU8 1353 aa55.98■■■■■ 6.55
AC006077.2-201ENST00000623591 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP55.94■■■■■ 6.55
AC006077.2-201ENST00000623591 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa55.91■■■■■ 6.54
AC006077.2-201ENST00000623591 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa55.89■■■■■ 6.54
AC006077.2-201ENST00000623591 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP55.72■■■■■ 6.51
AC006077.2-201ENST00000623591 CFTRP13569 1480 aa55.46■■■■■ 6.47
AC006077.2-201ENST00000623591 MRC2Q9UBG0 1479 aa55.44■■■■■ 6.47
AC006077.2-201ENST00000623591 CEP164Q9UPV0 1460 aa55.33■■■■■ 6.45
AC006077.2-201ENST00000623591 WDR62O43379 1518 aa55.32■■■■■ 6.45
AC006077.2-201ENST00000623591 FANCD2Q9BXW9 1451 aa55.3■■■■■ 6.44
AC006077.2-201ENST00000623591 CCDC88BA6NC98 1476 aa55.05■■■■■ 6.4
AC006077.2-201ENST00000623591 PRDM2Q13029 1718 aa55.01■■■■■ 6.4
AC006077.2-201ENST00000623591 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP54.8■■■■■ 6.36
AC006077.2-201ENST00000623591 ABCC8Q09428 1581 aa54.37■■■■■ 6.29
AC006077.2-201ENST00000623591 TOPBP1Q92547 1522 aa54.31■■■■■ 6.28
AC006077.2-201ENST00000623591 IFT140Q96RY7 1462 aa54.23■■■■■ 6.27
AC006077.2-201ENST00000623591 DNMBPQ6XZF7 1577 aa54.19■■■■■ 6.27
AC006077.2-201ENST00000623591 OSCARQ8IYS5 282 aa54.01■■■■■ 6.24
AC006077.2-201ENST00000623591 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP53.99■■■■■ 6.23
AC006077.2-201ENST00000623591 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP53.83■■■■■ 6.21
AC006077.2-201ENST00000623591 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP53.78■■■■■ 6.2
AC006077.2-201ENST00000623591 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.78■■■■■ 6.2
AC006077.2-201ENST00000623591 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP53.77■■■■■ 6.2
AC006077.2-201ENST00000623591 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP53.58■■■■■ 6.17
AC006077.2-201ENST00000623591 SOGA1O94964 1423 aa53.57■■■■■ 6.17
AC006077.2-201ENST00000623591 CUX1P39880 1505 aa53.53■■■■■ 6.16
AC006077.2-201ENST00000623591 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa53.52■■■■■ 6.16
AC006077.2-201ENST00000623591 FGD5Q6ZNL6 1462 aa53.5■■■■■ 6.15
AC006077.2-201ENST00000623591 TRIM41Q8WV44 630 aa53.49■■■■■ 6.15
AC006077.2-201ENST00000623591 WDR97A6NE52 1622 aa53.44■■■■■ 6.15
AC006077.2-201ENST00000623591 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP53.33■■■■■ 6.13
AC006077.2-201ENST00000623591 CHD1O14646 1710 aa53.29■■■■■ 6.12
AC006077.2-201ENST00000623591 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa53.19■■■■■ 6.11
AC006077.2-201ENST00000623591 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa53.19■■■■■ 6.11
AC006077.2-201ENST00000623591 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa53.19■■■■■ 6.11
AC006077.2-201ENST00000623591 FBLN2P98095 1184 aa53.1■■■■■ 6.09
AC006077.2-201ENST00000623591 ARHGEF11O15085 1522 aa53.08■■■■■ 6.09
AC006077.2-201ENST00000623591 GRIN2BQ13224 1484 aa53.07■■■■■ 6.09
AC006077.2-201ENST00000623591 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa53.06■■■■■ 6.08
AC006077.2-201ENST00000623591 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP53.05■■■■■ 6.08
AC006077.2-201ENST00000623591 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa52.99■■■■■ 6.07
AC006077.2-201ENST00000623591 GAPVD1Q14C86 1478 aa52.94■■■■■ 6.06
AC006077.2-201ENST00000623591 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa52.89■■■■■ 6.06
AC006077.2-201ENST00000623591 PBRM1Q86U86 1689 aa52.88■■■■■ 6.06
AC006077.2-201ENST00000623591 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP52.88■■■■■ 6.06
AC006077.2-201ENST00000623591 TOP2BQ02880 1626 aa52.88■■■■■ 6.05
AC006077.2-201ENST00000623591 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP52.87■■■■■ 6.05
AC006077.2-201ENST00000623591 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa52.85■■■■■ 6.05
AC006077.2-201ENST00000623591 SYNJ2O15056 1496 aa52.83■■■■■ 6.05
AC006077.2-201ENST00000623591 SYNJ1O43426 1573 aa52.76■■■■■ 6.04
AC006077.2-201ENST00000623591 CLASP1Q7Z460 1538 aa52.72■■■■■ 6.03
AC006077.2-201ENST00000623591 CYB5RLQ6IPT4 315 aa52.62■■■■■ 6.01
AC006077.2-201ENST00000623591 ARAP1Q96P48 1450 aa52.56■■■■■ 6
AC006077.2-201ENST00000623591 ADAMTS12P58397 1594 aa52.38■■■■■ 5.98
AC006077.2-201ENST00000623591 GRIN2AQ12879 1464 aa52.37■■■■■ 5.97
AC006077.2-201ENST00000623591 ERICH3Q5RHP9 1530 aa52.36■■■■■ 5.97
AC006077.2-201ENST00000623591 FHAD1B1AJZ9 1412 aa52.3■■■■■ 5.96
AC006077.2-201ENST00000623591 NUP160Q12769 1436 aa52.2■■■■■ 5.95
AC006077.2-201ENST00000623591 CEP170Q5SW79 1584 aa52.12■■■■■ 5.93
AC006077.2-201ENST00000623591 SHROOM2Q13796 1616 aa51.93■■■■■ 5.9
AC006077.2-201ENST00000623591 TRHP20396 242 aaPredicted RBP51.85■■■■■ 5.89
AC006077.2-201ENST00000623591 KIF27Q86VH2 1401 aa51.85■■■■■ 5.89
AC006077.2-201ENST00000623591 ERCC6L2Q5T890 1561 aa51.83■■■■■ 5.89
AC006077.2-201ENST00000623591 IGF1RP08069 1367 aa51.76■■■■■ 5.88
AC006077.2-201ENST00000623591 CUL7Q14999 1698 aa51.69■■■■■ 5.87
AC006077.2-201ENST00000623591 JPH4Q96JJ6 628 aa51.65■■■■■ 5.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms