Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SERPINC1P01008 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SERPINC1P01008 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SERPINC1P01008 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SERPINC1P01008 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SERPINC1P01008 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SERPINC1P01008 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SERPINC1P01008 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SERPINC1P01008 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SERPINC1P01008 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SERPINC1P01008 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SERPINC1P01008 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SERPINC1P01008 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SERPINC1P01008 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SERPINC1P01008 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SERPINC1P01008 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SERPINC1P01008 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SERPINC1P01008 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SERPINC1P01008 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SERPINC1P01008 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SERPINC1P01008 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SERPINC1P01008 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SERPINC1P01008 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SERPINC1P01008 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SERPINC1P01008 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SERPINC1P01008 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SERPINC1P01008 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SERPINC1P01008 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SERPINC1P01008 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SERPINC1P01008 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SERPINC1P01008 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SERPINC1P01008 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SERPINC1P01008 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SERPINC1P01008 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SERPINC1P01008 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SERPINC1P01008 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SERPINC1P01008 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SERPINC1P01008 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SERPINC1P01008 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SERPINC1P01008 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SERPINC1P01008 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SERPINC1P01008 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms