Protein–RNA interactions for Protein: O15523

DDX3Y, ATP-dependent RNA helicase DDX3Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3YO15523 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
DDX3YO15523 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDX3YO15523 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX3YO15523 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX3YO15523 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX3YO15523 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX3YO15523 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX3YO15523 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX3YO15523 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DDX3YO15523 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDX3YO15523 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX3YO15523 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX3YO15523 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX3YO15523 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX3YO15523 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX3YO15523 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX3YO15523 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX3YO15523 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX3YO15523 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX3YO15523 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX3YO15523 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX3YO15523 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX3YO15523 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX3YO15523 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX3YO15523 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms