Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CCER2I3L3R5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCER2I3L3R5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CCER2I3L3R5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCER2I3L3R5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CCER2I3L3R5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCER2I3L3R5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CCER2I3L3R5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCER2I3L3R5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCER2I3L3R5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCER2I3L3R5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCER2I3L3R5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCER2I3L3R5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCER2I3L3R5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCER2I3L3R5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCER2I3L3R5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCER2I3L3R5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCER2I3L3R5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCER2I3L3R5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCER2I3L3R5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCER2I3L3R5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
CCER2I3L3R5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCER2I3L3R5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCER2I3L3R5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCER2I3L3R5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCER2I3L3R5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCER2I3L3R5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCER2I3L3R5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCER2I3L3R5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CCER2I3L3R5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCER2I3L3R5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCER2I3L3R5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCER2I3L3R5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCER2I3L3R5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCER2I3L3R5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCER2I3L3R5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCER2I3L3R5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCER2I3L3R5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCER2I3L3R5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCER2I3L3R5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCER2I3L3R5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCER2I3L3R5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCER2I3L3R5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCER2I3L3R5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCER2I3L3R5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCER2I3L3R5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCER2I3L3R5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCER2I3L3R5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCER2I3L3R5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCER2I3L3R5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CCER2I3L3R5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CCER2I3L3R5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms