Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms