Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms