Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZFYVE27Q5T4F4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZFYVE27Q5T4F4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZFYVE27Q5T4F4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZFYVE27Q5T4F4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZFYVE27Q5T4F4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZFYVE27Q5T4F4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZFYVE27Q5T4F4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZFYVE27Q5T4F4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZFYVE27Q5T4F4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZFYVE27Q5T4F4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZFYVE27Q5T4F4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZFYVE27Q5T4F4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZFYVE27Q5T4F4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZFYVE27Q5T4F4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZFYVE27Q5T4F4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms