Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPAT3Q53EU6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAT3Q53EU6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPAT3Q53EU6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAT3Q53EU6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPAT3Q53EU6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPAT3Q53EU6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms