Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSR1P43307 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSR1P43307 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSR1P43307 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSR1P43307 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSR1P43307 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSR1P43307 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSR1P43307 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SSR1P43307 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSR1P43307 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSR1P43307 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSR1P43307 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSR1P43307 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSR1P43307 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSR1P43307 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSR1P43307 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSR1P43307 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSR1P43307 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSR1P43307 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSR1P43307 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSR1P43307 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSR1P43307 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSR1P43307 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSR1P43307 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SSR1P43307 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSR1P43307 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSR1P43307 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SSR1P43307 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSR1P43307 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSR1P43307 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSR1P43307 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSR1P43307 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSR1P43307 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSR1P43307 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SSR1P43307 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSR1P43307 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSR1P43307 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSR1P43307 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSR1P43307 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SSR1P43307 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSR1P43307 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SSR1P43307 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SSR1P43307 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSR1P43307 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SSR1P43307 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSR1P43307 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSR1P43307 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSR1P43307 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SSR1P43307 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SSR1P43307 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSR1P43307 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSR1P43307 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SSR1P43307 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSR1P43307 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSR1P43307 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSR1P43307 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSR1P43307 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSR1P43307 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSR1P43307 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSR1P43307 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSR1P43307 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSR1P43307 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSR1P43307 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSR1P43307 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSR1P43307 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSR1P43307 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSR1P43307 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSR1P43307 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSR1P43307 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSR1P43307 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSR1P43307 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSR1P43307 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSR1P43307 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSR1P43307 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SSR1P43307 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSR1P43307 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSR1P43307 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSR1P43307 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSR1P43307 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSR1P43307 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSR1P43307 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSR1P43307 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSR1P43307 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSR1P43307 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSR1P43307 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSR1P43307 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSR1P43307 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSR1P43307 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSR1P43307 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSR1P43307 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSR1P43307 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSR1P43307 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSR1P43307 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSR1P43307 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSR1P43307 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSR1P43307 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSR1P43307 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSR1P43307 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSR1P43307 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSR1P43307 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms