Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRD1A4D1F6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRD1A4D1F6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRD1A4D1F6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRD1A4D1F6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRD1A4D1F6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRD1A4D1F6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRD1A4D1F6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRD1A4D1F6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRD1A4D1F6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRD1A4D1F6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRD1A4D1F6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRD1A4D1F6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRD1A4D1F6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRD1A4D1F6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms