RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219548.8

STUB1-201, Transcript of STIP1 homology and U-box containing protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STUB1, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1-201ENST00000219548 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.6■■■■■ 7.77
STUB1-201ENST00000219548 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.28■■■■■ 6.6
STUB1-201ENST00000219548 ABCC9O60706 1549 aa54.46■■■■■ 6.31
STUB1-201ENST00000219548 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.13■■■■■ 6.1
STUB1-201ENST00000219548 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.89■■■■■ 6.06
STUB1-201ENST00000219548 NACADO15069 1562 aa52.69■■■■■ 6.03
STUB1-201ENST00000219548 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.62■■■■■ 6.01
STUB1-201ENST00000219548 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.59■■■■■ 6.01
STUB1-201ENST00000219548 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.53■■■■■ 6
STUB1-201ENST00000219548 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.61■■■■■ 5.85
STUB1-201ENST00000219548 SCRIBQ14160 1630 aa51.48■■■■■ 5.83
STUB1-201ENST00000219548 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.06■■■■■ 5.76
STUB1-201ENST00000219548 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.98■■■■■ 5.75
STUB1-201ENST00000219548 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.75■■■■■ 5.71
STUB1-201ENST00000219548 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.64■■■■■ 5.54
STUB1-201ENST00000219548 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.52■■■■■ 5.52
STUB1-201ENST00000219548 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.35■■■■■ 5.49
STUB1-201ENST00000219548 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.3■■■■■ 5.48
STUB1-201ENST00000219548 SMARCA4P51532 1647 aa49.26■■■■■ 5.48
STUB1-201ENST00000219548 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.24■■■■■ 5.47
STUB1-201ENST00000219548 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.07■■■■■ 5.45
STUB1-201ENST00000219548 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.76■■■■■ 5.4
STUB1-201ENST00000219548 SMARCA2P51531 1590 aa48.73■■■■■ 5.39
STUB1-201ENST00000219548 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.71■■■■■ 5.39
STUB1-201ENST00000219548 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.7■■■■■ 5.39
STUB1-201ENST00000219548 WIZO95785 1651 aa48.64■■■■■ 5.38
STUB1-201ENST00000219548 NCAPD3P42695 1498 aa48.59■■■■■ 5.37
STUB1-201ENST00000219548 HMGXB3Q12766 1538 aa48.46■■■■■ 5.35
STUB1-201ENST00000219548 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.42■■■■■ 5.34
STUB1-201ENST00000219548 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.08■■■■■ 5.29
STUB1-201ENST00000219548 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.04■■■■■ 5.28
STUB1-201ENST00000219548 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.51■■■■■ 5.2
STUB1-201ENST00000219548 NESP48681 1621 aa47.35■■■■■ 5.17
STUB1-201ENST00000219548 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.25■■■■■ 5.15
STUB1-201ENST00000219548 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.22■■■■■ 5.15
STUB1-201ENST00000219548 CFTRP13569 1480 aa47.1■■■■■ 5.13
STUB1-201ENST00000219548 PRDM2Q13029 1718 aa46.95■■■■■ 5.11
STUB1-201ENST00000219548 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.87■■■■■ 5.09
STUB1-201ENST00000219548 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.86■■■■■ 5.09
STUB1-201ENST00000219548 ERCC6Q03468 1493 aa46.85■■■■■ 5.09
STUB1-201ENST00000219548 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.73■■■■■ 5.07
STUB1-201ENST00000219548 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.61■■■■■ 5.05
STUB1-201ENST00000219548 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.48■■■■■ 5.03
STUB1-201ENST00000219548 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.39■■■■■ 5.02
STUB1-201ENST00000219548 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.25■■■■■ 4.99
STUB1-201ENST00000219548 WDR62O43379 1518 aa46.23■■■■■ 4.99
STUB1-201ENST00000219548 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.08■■■■■ 4.97
STUB1-201ENST00000219548 TOPBP1Q92547 1522 aa46.07■■■■■ 4.97
STUB1-201ENST00000219548 ABCC8Q09428 1581 aa46.07■■■■■ 4.97
STUB1-201ENST00000219548 CUX2O14529 1486 aa46.05■■■■■ 4.96
STUB1-201ENST00000219548 CUX1P39880 1505 aa46■■■■■ 4.95
STUB1-201ENST00000219548 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.9■■■■■ 4.94
STUB1-201ENST00000219548 SYNJ1O43426 1573 aa45.84■■■■■ 4.93
STUB1-201ENST00000219548 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.79■■■■■ 4.92
STUB1-201ENST00000219548 TOP2BQ02880 1626 aa45.77■■■■■ 4.92
STUB1-201ENST00000219548 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
STUB1-201ENST00000219548 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.73■■■■■ 4.91
STUB1-201ENST00000219548 IFT140Q96RY7 1462 aa45.56■■■■■ 4.88
STUB1-201ENST00000219548 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.55■■■■■ 4.88
STUB1-201ENST00000219548 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.55■■■■■ 4.88
STUB1-201ENST00000219548 SOGA1O94964 1423 aa45.51■■■■■ 4.88
STUB1-201ENST00000219548 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
STUB1-201ENST00000219548 WDR97A6NE52 1622 aa45.38■■■■■ 4.86
STUB1-201ENST00000219548 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.27■■■■■ 4.84
STUB1-201ENST00000219548 TRIM41Q8WV44 630 aa45.27■■■■■ 4.84
STUB1-201ENST00000219548 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
STUB1-201ENST00000219548 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.21■■■■■ 4.83
STUB1-201ENST00000219548 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.19■■■■■ 4.821e-6■■■■□ 24.9
STUB1-201ENST00000219548 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.17■■■■■ 4.82
STUB1-201ENST00000219548 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.1■■■■■ 4.81
STUB1-201ENST00000219548 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.02■■■■■ 4.8
STUB1-201ENST00000219548 PBRM1Q86U86 1689 aa44.99■■■■■ 4.79
STUB1-201ENST00000219548 GRIN2BQ13224 1484 aa44.9■■■■■ 4.78
STUB1-201ENST00000219548 KIF27Q86VH2 1401 aa44.87■■■■■ 4.77
STUB1-201ENST00000219548 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.8■■■■■ 4.76
STUB1-201ENST00000219548 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.78■■■■■ 4.76
STUB1-201ENST00000219548 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.74■■■■■ 4.75
STUB1-201ENST00000219548 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
STUB1-201ENST00000219548 ADAMTS12P58397 1594 aa44.62■■■■■ 4.73
STUB1-201ENST00000219548 CHD1O14646 1710 aa44.62■■■■■ 4.73
STUB1-201ENST00000219548 IGF1RP08069 1367 aa44.6■■■■■ 4.73
STUB1-201ENST00000219548 SYNJ2O15056 1496 aa44.54■■■■■ 4.72
STUB1-201ENST00000219548 CUL7Q14999 1698 aa44.51■■■■■ 4.72
STUB1-201ENST00000219548 FBLN2P98095 1184 aa44.51■■■■■ 4.72
STUB1-201ENST00000219548 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.49■■■■■ 4.71
STUB1-201ENST00000219548 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
STUB1-201ENST00000219548 EEA1Q15075 1411 aa44.42■■■■■ 4.7
STUB1-201ENST00000219548 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
STUB1-201ENST00000219548 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.36■■■■■ 4.69
STUB1-201ENST00000219548 GRIN2AQ12879 1464 aa44.35■■■■■ 4.69
STUB1-201ENST00000219548 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.28■■■■■ 4.68
STUB1-201ENST00000219548 OSCARQ8IYS5 282 aa44.24■■■■■ 4.67
STUB1-201ENST00000219548 PRXQ9BXM0 1461 aa44.2■■■■■ 4.67
STUB1-201ENST00000219548 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.18■■■■■ 4.66
STUB1-201ENST00000219548 CEP170Q5SW79 1584 aa44.16■■■■■ 4.66
STUB1-201ENST00000219548 NUP160Q12769 1436 aa44.1■■■■■ 4.65
STUB1-201ENST00000219548 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.04■■■■■ 4.64
STUB1-201ENST00000219548 KIF21BO75037 1637 aa44.01■■■■■ 4.64
STUB1-201ENST00000219548 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.85■■■■■ 4.61
STUB1-201ENST00000219548 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.84■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms