Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX24Q9Y343 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX24Q9Y343 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX24Q9Y343 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX24Q9Y343 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX24Q9Y343 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SNX24Q9Y343 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX24Q9Y343 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX24Q9Y343 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX24Q9Y343 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX24Q9Y343 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX24Q9Y343 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX24Q9Y343 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX24Q9Y343 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX24Q9Y343 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX24Q9Y343 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX24Q9Y343 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX24Q9Y343 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX24Q9Y343 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX24Q9Y343 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX24Q9Y343 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX24Q9Y343 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX24Q9Y343 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX24Q9Y343 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX24Q9Y343 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX24Q9Y343 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX24Q9Y343 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX24Q9Y343 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX24Q9Y343 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX24Q9Y343 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms