Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPS28Q9Y2Q9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS28Q9Y2Q9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS28Q9Y2Q9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS28Q9Y2Q9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPS28Q9Y2Q9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPS28Q9Y2Q9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS28Q9Y2Q9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS28Q9Y2Q9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS28Q9Y2Q9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPS28Q9Y2Q9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPS28Q9Y2Q9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPS28Q9Y2Q9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS28Q9Y2Q9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS28Q9Y2Q9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPS28Q9Y2Q9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS28Q9Y2Q9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS28Q9Y2Q9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPS28Q9Y2Q9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS28Q9Y2Q9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPS28Q9Y2Q9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPS28Q9Y2Q9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms