Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJP4

KLHL21, Kelch-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL21Q9UJP4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL21Q9UJP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL21Q9UJP4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL21Q9UJP4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL21Q9UJP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL21Q9UJP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL21Q9UJP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL21Q9UJP4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL21Q9UJP4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL21Q9UJP4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL21Q9UJP4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL21Q9UJP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL21Q9UJP4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL21Q9UJP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL21Q9UJP4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL21Q9UJP4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL21Q9UJP4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL21Q9UJP4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL21Q9UJP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL21Q9UJP4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL21Q9UJP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL21Q9UJP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL21Q9UJP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL21Q9UJP4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL21Q9UJP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL21Q9UJP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL21Q9UJP4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL21Q9UJP4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL21Q9UJP4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL21Q9UJP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL21Q9UJP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL21Q9UJP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms