RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318348.8

GLTP-201, Transcript of glycolipid transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GLTP, Length 2,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTP-201ENST00000318348 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.66■■■■■ 6.66
GLTP-201ENST00000318348 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.45■■■■■ 5.35
GLTP-201ENST00000318348 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
GLTP-201ENST00000318348 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.78■■■■■ 5.24
GLTP-201ENST00000318348 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.72■■■■■ 5.07
GLTP-201ENST00000318348 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
GLTP-201ENST00000318348 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.61■■■■■ 5.05
GLTP-201ENST00000318348 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.41■■■■■ 4.86
GLTP-201ENST00000318348 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.34■■■■■ 4.85
GLTP-201ENST00000318348 SCRIBQ14160 1630 aa45.18■■■■■ 4.82
GLTP-201ENST00000318348 ABCC9O60706 1549 aa45.13■■■■■ 4.82
GLTP-201ENST00000318348 NACADO15069 1562 aa44.82■■■■■ 4.77
GLTP-201ENST00000318348 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
GLTP-201ENST00000318348 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.15■■■■■ 4.66
GLTP-201ENST00000318348 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.15■■■■■ 4.66
GLTP-201ENST00000318348 MROH2BQ7Z745 1585 aa44■■■■■ 4.63
GLTP-201ENST00000318348 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.88■■■■■ 4.62
GLTP-201ENST00000318348 WIZO95785 1651 aa43.74■■■■■ 4.59
GLTP-201ENST00000318348 TRIM41Q8WV44 630 aa43.56■■■■■ 4.56
GLTP-201ENST00000318348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
GLTP-201ENST00000318348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.5■■■■■ 4.55
GLTP-201ENST00000318348 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.43■■■■■ 4.54
GLTP-201ENST00000318348 HRCP23327 699 aa43.3■■■■■ 4.52
GLTP-201ENST00000318348 SMARCA4P51532 1647 aa43.24■■■■■ 4.51
GLTP-201ENST00000318348 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
GLTP-201ENST00000318348 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
GLTP-201ENST00000318348 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
GLTP-201ENST00000318348 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.98■■■■■ 4.47
GLTP-201ENST00000318348 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.86■■■■■ 4.45
GLTP-201ENST00000318348 SMARCA2P51531 1590 aa42.85■■■■■ 4.45
GLTP-201ENST00000318348 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.83■■■■■ 4.45
GLTP-201ENST00000318348 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
GLTP-201ENST00000318348 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.64■■■■■ 4.42
GLTP-201ENST00000318348 ABCC8Q09428 1581 aa42.59■■■■■ 4.41
GLTP-201ENST00000318348 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.5■■■■■ 4.39
GLTP-201ENST00000318348 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
GLTP-201ENST00000318348 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.19■■■■■ 4.34
GLTP-201ENST00000318348 SOGA1O94964 1423 aa42.1■■■■■ 4.33
GLTP-201ENST00000318348 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
GLTP-201ENST00000318348 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.3
GLTP-201ENST00000318348 EEA1Q15075 1411 aa41.92■■■■■ 4.3
GLTP-201ENST00000318348 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.92■■■■■ 4.3
GLTP-201ENST00000318348 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.8■■■■■ 4.28
GLTP-201ENST00000318348 SYNJ1O43426 1573 aa41.79■■■■■ 4.28
GLTP-201ENST00000318348 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.76■■■■■ 4.27
GLTP-201ENST00000318348 CEP162Q5TB80 1403 aa41.76■■■■■ 4.27
GLTP-201ENST00000318348 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
GLTP-201ENST00000318348 GOLGA3Q08378 1498 aa41.58■■■■■ 4.25
GLTP-201ENST00000318348 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
GLTP-201ENST00000318348 HMGXB3Q12766 1538 aa41.46■■■■■ 4.23
GLTP-201ENST00000318348 NCAPD3P42695 1498 aa41.45■■■■■ 4.23
GLTP-201ENST00000318348 KIF21BO75037 1637 aa41.41■■■■■ 4.22
GLTP-201ENST00000318348 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.39■■■■■ 4.22
GLTP-201ENST00000318348 TOP2BQ02880 1626 aa41.35■■■■■ 4.21
GLTP-201ENST00000318348 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.24■■■■■ 4.19
GLTP-201ENST00000318348 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
GLTP-201ENST00000318348 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.11■■■■■ 4.17
GLTP-201ENST00000318348 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
GLTP-201ENST00000318348 CLIP1P30622 1438 aa41.05■■■■■ 4.16
GLTP-201ENST00000318348 CFTRP13569 1480 aa41.02■■■■■ 4.16
GLTP-201ENST00000318348 CUX1P39880 1505 aa41■■■■■ 4.15
GLTP-201ENST00000318348 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
GLTP-201ENST00000318348 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.87■■■■■ 4.13
GLTP-201ENST00000318348 PRXQ9BXM0 1461 aa40.83■■■■■ 4.13
GLTP-201ENST00000318348 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.81■■■■■ 4.12
GLTP-201ENST00000318348 PRDM2Q13029 1718 aa40.75■■■■■ 4.11
GLTP-201ENST00000318348 KIF27Q86VH2 1401 aa40.67■■■■■ 4.1
GLTP-201ENST00000318348 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
GLTP-201ENST00000318348 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.58■■■■■ 4.09
GLTP-201ENST00000318348 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.56■■■■■ 4.08
GLTP-201ENST00000318348 ARAP1Q96P48 1450 aa40.5■■■■■ 4.07
GLTP-201ENST00000318348 APLP2Q06481 763 aa40.49■■■■■ 4.07
GLTP-201ENST00000318348 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
GLTP-201ENST00000318348 CUX2O14529 1486 aa40.34■■■■■ 4.05
GLTP-201ENST00000318348 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.29■■■■■ 4.04
GLTP-201ENST00000318348 IGF1RP08069 1367 aa40.27■■■■■ 4.04
GLTP-201ENST00000318348 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.2■■■■■ 4.03
GLTP-201ENST00000318348 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.19■■■■■ 4.02
GLTP-201ENST00000318348 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
GLTP-201ENST00000318348 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.07■■■■■ 4
GLTP-201ENST00000318348 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40■■■■□ 3.99
GLTP-201ENST00000318348 NESP48681 1621 aa39.99■■■■□ 3.99
GLTP-201ENST00000318348 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
GLTP-201ENST00000318348 TOPBP1Q92547 1522 aa39.92■■■■□ 3.98
GLTP-201ENST00000318348 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.89■■■■□ 3.98
GLTP-201ENST00000318348 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
GLTP-201ENST00000318348 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
GLTP-201ENST00000318348 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.86■■■■□ 3.97
GLTP-201ENST00000318348 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
GLTP-201ENST00000318348 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.74■■■■□ 3.95
GLTP-201ENST00000318348 TIAM1Q13009 1591 aa39.72■■■■□ 3.95
GLTP-201ENST00000318348 MAP3K1Q13233 1512 aa39.71■■■■□ 3.95
GLTP-201ENST00000318348 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.68■■■■□ 3.94
GLTP-201ENST00000318348 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
GLTP-201ENST00000318348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
GLTP-201ENST00000318348 CUL7Q14999 1698 aa39.61■■■■□ 3.93
GLTP-201ENST00000318348 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
GLTP-201ENST00000318348 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.59■■■■□ 3.93
GLTP-201ENST00000318348 WDR97A6NE52 1622 aa39.59■■■■□ 3.93
GLTP-201ENST00000318348 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.57■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms