RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614297.1

ABCB10P1-201, Transcript of ABCB10 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ABCB10P1, Length 2,181 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB10P1-201ENST00000614297 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.03■■■■■ 6.72
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ABCB10P1-201ENST00000614297 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.9■■■■■ 5.1
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ABCB10P1-201ENST00000614297 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.25■■■■■ 4.83
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ABCB10P1-201ENST00000614297 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.64■■■■■ 4.74
ABCB10P1-201ENST00000614297 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.44■■■■■ 4.7
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ABCB10P1-201ENST00000614297 WIZO95785 1651 aa44■■■■■ 4.63
ABCB10P1-201ENST00000614297 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.99■■■■■ 4.63
ABCB10P1-201ENST00000614297 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
ABCB10P1-201ENST00000614297 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.8■■■■■ 4.6
ABCB10P1-201ENST00000614297 TRIM41Q8WV44 630 aa43.65■■■■■ 4.58
ABCB10P1-201ENST00000614297 SMARCA4P51532 1647 aa43.57■■■■■ 4.57
ABCB10P1-201ENST00000614297 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.44■■■■■ 4.54
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ABCB10P1-201ENST00000614297 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.36■■■■■ 4.53
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ABCB10P1-201ENST00000614297 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
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ABCB10P1-201ENST00000614297 SMARCA2P51531 1590 aa43.09■■■■■ 4.49
ABCB10P1-201ENST00000614297 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.83■■■■■ 4.45
ABCB10P1-201ENST00000614297 HRCP23327 699 aa42.82■■■■■ 4.44
ABCB10P1-201ENST00000614297 ABCC8Q09428 1581 aa42.77■■■■■ 4.44
ABCB10P1-201ENST00000614297 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.73■■■■■ 4.43
ABCB10P1-201ENST00000614297 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
ABCB10P1-201ENST00000614297 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.56■■■■■ 4.4
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ABCB10P1-201ENST00000614297 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.04■■■■■ 4.32
ABCB10P1-201ENST00000614297 EEA1Q15075 1411 aa42.02■■■■■ 4.32
ABCB10P1-201ENST00000614297 SYNJ1O43426 1573 aa41.99■■■■■ 4.31
ABCB10P1-201ENST00000614297 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
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ABCB10P1-201ENST00000614297 NCAPD3P42695 1498 aa41.87■■■■■ 4.29
ABCB10P1-201ENST00000614297 HMGXB3Q12766 1538 aa41.86■■■■■ 4.29
ABCB10P1-201ENST00000614297 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.78■■■■■ 4.28
ABCB10P1-201ENST00000614297 CEP162Q5TB80 1403 aa41.78■■■■■ 4.28
ABCB10P1-201ENST00000614297 GOLGA3Q08378 1498 aa41.67■■■■■ 4.26
ABCB10P1-201ENST00000614297 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
ABCB10P1-201ENST00000614297 TOP2BQ02880 1626 aa41.57■■■■■ 4.25
ABCB10P1-201ENST00000614297 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.51■■■■■ 4.23
ABCB10P1-201ENST00000614297 KIF21BO75037 1637 aa41.5■■■■■ 4.23
ABCB10P1-201ENST00000614297 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.46■■■■■ 4.23
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ABCB10P1-201ENST00000614297 CLIP1P30622 1438 aa41.13■■■■■ 4.17
ABCB10P1-201ENST00000614297 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.11■■■■■ 4.17
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ABCB10P1-201ENST00000614297 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.95■■■■■ 4.15
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ABCB10P1-201ENST00000614297 KIF27Q86VH2 1401 aa40.91■■■■■ 4.14
ABCB10P1-201ENST00000614297 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.91■■■■■ 4.14
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ABCB10P1-201ENST00000614297 CUX2O14529 1486 aa40.62■■■■■ 4.09
ABCB10P1-201ENST00000614297 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.6■■■■■ 4.09
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ABCB10P1-201ENST00000614297 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.58■■■■■ 4.09
ABCB10P1-201ENST00000614297 ARAP1Q96P48 1450 aa40.57■■■■■ 4.09
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ABCB10P1-201ENST00000614297 NESP48681 1621 aa40.43■■■■■ 4.06
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ABCB10P1-201ENST00000614297 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.31■■■■■ 4.04
ABCB10P1-201ENST00000614297 TOPBP1Q92547 1522 aa40.27■■■■■ 4.04
ABCB10P1-201ENST00000614297 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.22■■■■■ 4.03
ABCB10P1-201ENST00000614297 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
ABCB10P1-201ENST00000614297 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.19■■■■■ 4.02
ABCB10P1-201ENST00000614297 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
ABCB10P1-201ENST00000614297 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.16■■■■■ 4.02
ABCB10P1-201ENST00000614297 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.07■■■■■ 4
ABCB10P1-201ENST00000614297 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
ABCB10P1-201ENST00000614297 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.9■■■■□ 3.98
ABCB10P1-201ENST00000614297 WDR97A6NE52 1622 aa39.9■■■■□ 3.98
ABCB10P1-201ENST00000614297 CUL7Q14999 1698 aa39.88■■■■□ 3.98
ABCB10P1-201ENST00000614297 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
ABCB10P1-201ENST00000614297 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.81■■■■□ 3.96
ABCB10P1-201ENST00000614297 TIAM1Q13009 1591 aa39.81■■■■□ 3.96
ABCB10P1-201ENST00000614297 MAP3K1Q13233 1512 aa39.77■■■■□ 3.96
ABCB10P1-201ENST00000614297 P3H3Q8IVL6 736 aa39.74■■■■□ 3.95
ABCB10P1-201ENST00000614297 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
ABCB10P1-201ENST00000614297 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.73■■■■□ 3.95
ABCB10P1-201ENST00000614297 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.73■■■■□ 3.95
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