Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NANOGQ9H9S0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NANOGQ9H9S0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NANOGQ9H9S0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NANOGQ9H9S0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NANOGQ9H9S0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NANOGQ9H9S0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NANOGQ9H9S0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NANOGQ9H9S0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NANOGQ9H9S0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NANOGQ9H9S0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NANOGQ9H9S0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NANOGQ9H9S0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NANOGQ9H9S0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NANOGQ9H9S0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NANOGQ9H9S0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NANOGQ9H9S0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NANOGQ9H9S0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NANOGQ9H9S0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NANOGQ9H9S0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NANOGQ9H9S0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NANOGQ9H9S0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NANOGQ9H9S0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NANOGQ9H9S0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NANOGQ9H9S0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NANOGQ9H9S0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NANOGQ9H9S0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NANOGQ9H9S0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NANOGQ9H9S0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NANOGQ9H9S0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NANOGQ9H9S0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NANOGQ9H9S0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms